马坞乡的历史可以追溯至明代，那时已有先民在此繁衍生息。在那个时代，这片土地被称为顿马。在解放前，它隶属于马沿乡。随着历史的进程，1949年后，马坞乡正式设立，归属于马沿区的行政管辖。1958年，区划改革使得马沿区被撤销，取而代之的是马沿公社，马坞乡也随之转变为马坞管理区。
1961年，马坞乡再次经历变动，隶属于闾井区的马坞公社成立。然而，年底时，由于行政区划调整，马坞乡被分为两个部分，即马坞公社和沙金公社。然而，这种划分并未持久，1969年，区划并社的政策实施，马坞和沙金两个公社合并，再次形成了马坞公社。这一阶段的变迁反映了当时农村行政体系的调整与重构。
最后，到了1982年12月，马坞乡的名字有了新的含义，它正式更名为马坞乡人民政府，这个名称一直沿用至今，见证了马坞乡从古至今的发展历程。这段历史记录了马坞乡从明代以来的变迁，是一部活生生的乡土历史长卷。
马坞乡位于甘肃省岷县县城东部，乡人民政府驻灯场村，总人口11832人，现辖7个村委会，48个村民小组，马沿乡地处山林地带，草山遍布全乡，是发展畜牧业的天然场所。