山西医科大学是二本。山西医科大学是全国开办七年制临床医学专业的25所医学院校之一，其在山西既有本科一批招生又有本科二批招生，在外省大部分为本科二批招生，所以可以认为山西医科大学是二本大学。
重点学科
截至2021年1月，学校有5个国家一流本科专业建设点，5个国家级特色专业建设点，3个教育部首批国家“本科教学工程”地方高校本科专业综合改革试点专业;3个国家级示范中心。
国家级示范中心：临床技能实训中心、基础医学实验教学中心、临床教学培训示范中心
教育部首批国家“本科教学工程”地方高校本科专业综合改革试点专业：临床医学(五年制)、临床医学(农村定向免费生)、护理专业
教育部首批卓越医生教育培养计划试点单位：临床医学
山西省品牌专业：临床医学、预防医学、法医学、口腔医学、药学、医学影像学、护理学
山西省特色专业：口腔医学、药物制剂、麻醉学、医学影像学、公共事业管理(卫生事业管理方向)、中药学