笛卡尔的哲学观点在经验主义和唯物主义的视角下，因其名言“我思故我在”而备受争议。这一被笛卡尔视为哲学基石的言论，在东欧和中国学界被批评为极端主观唯心主义的典型，遭到严厉批判。人们常引用“存在先于意识”和“没有肉体就没有思想”等论据，质疑笛卡尔的逻辑，指责其“本末倒置”、“荒谬可笑”。对笛卡尔哲学的质疑之路充满了挑战，他的哲学始于对人类认知能力最根本的质疑，他指出：“所有我以为真实的东西，源于感觉，但发现它们时常误导，因此，唯一明智是质疑一切。”
笛卡尔质疑外部世界对认知的可靠性，进而探究主动感知和思维的本质。他提出，我们的感知活动，即使是实践活动（在辩证唯物主义中称为“实践”），也可能被梦境混淆，使得“梦”与“醒”难以区分。这种怀疑扩展至：“我怀疑，整个世界是否只是一个梦幻，如庄子与蝴蝶的寓言。”
笛卡尔的怀疑并非针对具体事物或原理，而是对人类、世界和上帝的彻底怀疑。他试图从这种绝对怀疑中推导出不容置疑的哲学原则，这是一种对所有认识基础的彻底质疑和重构。他的哲学探索，从最根本的疑问出发，寻求的是对真理本质的揭示和理解。
笛卡尔的我思故我在是笛卡尔全部认识论哲学的起点，也是他“普遍怀疑”的终点。他从这一点出发确证了人类知识的合法性。也就是说：笛卡尔是唯心主义者，但并不是从此命题看出来的，我思故我在并不是唯心命题，而是纯粹认识论的内容。说笛卡尔是唯心论者是纵观他的哲学体系而得出的结论，而并不是从这一命题，它既不是唯物也不是唯心 。