首先，太平军的宣传、动员能力比天地会强大得多。太平军从一开始就深入民众宣扬建立“人间天国”的思想，这对于当时生活极端困苦、急于追求温饱的贫苦大众很有吸引力。后来，洪秀全等人更是直接喊出“攻占江宁（南京）去小天堂享福”的目标，相比天地会“反清复明”的空洞口号，前者显然更容易实现而且对老百姓的诱惑力也更大。
其次，太平军因为有“拜上帝教”作为内部信仰，而且采取了“政教合一”的严密组织形式，所以不仅能够在架构组织方面超越传统的秘密会党（比如天地会），还使得太平军在一定程度上超越了地域、宗族限制，而能够广泛吸纳各地、各阶层民众加入。太平军鼎盛时期，军政号令统一，上下齐心，官兵一致，拥有自上而下的统一组织架构和领导集团。反观天地会则不然，各地“堂口”互不统属，派系林立，缺乏有权威的最高统帅部，发动起义则基本上局限于本地、本省，而且内部往往以血缘为纽带形成很强排他性的宗族小团体。比如乾隆年间林爽文在台湾发动天地会起义之所以失败的一个重要原因，就是由于闽南人与客家人、不同会党之间的深刻矛盾引发内部分裂（漳泉械斗），结果被清政府利用各个击破。1853年湖南天地会配合太平军起义时，也被号称“湘军先驱”的江忠源分化瓦解而击败。
太平天国时期，广西、广东、福建、江西、浙江的天地会先后爆发起义，但他们基本上都属于孤军作战，相互间很少有联合与配合，最后都被镇压下去。相比而言，太平军作战就比较注重协同配合，打仗也更有章法，所以能够成为让清政府恐惧不已的劲敌。第三点，天地会发动起义的时机比较差、遭遇的对手也比较强。仍以林爽文为例，他发动的天地会起义估计是这个组织历次起义中规模最大、对清廷震动也最强的一次，林爽文起义军鼎盛时期控制了除府城、诸罗、鹿港之外的全台大部地区，义军人数达数十万之众。但问题在于，当时虽已是乾隆统治后期（1786年起义爆发），但清政府无论军事、经济还是统治集团实力仍然很强，结果清廷先后派出2拨军队、不到4万人跨海登陆征剿，特别是第2路统帅福康安率精兵8000人，在6000地方团练武装配合下就一举击破林爽文3万主力部队，从而逆转战局。可见，以当时清军的战斗力来讲，大部分农民起义还是有把握镇压下去的。
而太平军起事时，清军2大主力——八旗兵和绿营都已衰朽不堪，战斗力纯属豆腐渣，只敢一路尾随太平军从珠江流域直到长江三角洲。等到1860年太平军第2次攻破江南大营导致绿营主力溃散后，清廷干脆不再依靠“中央军”，而将镇压太平军的希望全都寄托在曾国藩、李鸿章等人编练的湘淮军身上。