建筑与土木工程系于2010年8月由原城市建设与环境系调整设立。各专业办学历史可追溯到1985年原皖西联合大学创办的土木工程专业和原城市建设与环境系2005年创办的建筑学专业及2007年创办的给水排水专业。
建筑与土木工程系现有专任教师45人，其中专兼职教授副教授12人，讲师22人，实验师2人，专任教师中有博士和在读博士10人，硕士35人，有国家一级注册建筑师1人、国家一级注册结构工程师2人、注册造价工程师1人、一级建造师1人。近三年来，全系教师承担省哲学社会科学规划办、科技厅、教育厅等省、厅、市和校级科研项目30余项，在国内外学术刊物上公开发表论文110余篇，其中权威和核心期刊论文近40篇，参编和出版专著、教材6部。
全系现有建筑学、土木工程、给水排水工程三个本科专业，设有建筑学、土木工程、给水排水三个教研室和土木工程、建筑学、给水排水三大门类实验室，下设力学实验室、建筑结构实验室、建筑材料实验室、测量实验室、土力学与地基基础实验室、CAD实验室、建筑物理实验室、建筑模型实验室、给排水实验室等9个专业实验室。实验室总建筑面积约4750㎡，具有较先进的仪器设备，实验设备资产总值约600万元，并在皖南、合肥、六安等地建有学生专业实习基地。
近来年，本系各专业毕业生综合素质获得用人单位的赞誉，就业保持了良好的势头，毕业生考研率也位于学院前列，其中首届建筑学毕业生考研率占毕业生人数的21%。毕业生就业率连年达到98%以上，连续多次荣获学校“就业先进单位”。
建筑与土木工程系将坚持以应用性、创新型人才为培养目标，以学科专业建设为龙头，以教学改革为核心，以科研为动力，以提高教学质量为根本，注重课程体系和特色课程建设，加强实习基地建设和实践教学，着力提高学生的实践能力和创新能力，积极为示范应用型本科高校建设做出新贡献，努力培养适应社会经济发展的各类应用型科技人才。
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