顶端；侧边；底部
杀菌灯对鱼缸消毒有三种位置可放：一是放在顶端；二是放在侧边；三是放入底部。选择沉入放在底部的，最好是鱼缸封闭掉，那样的效果会更好些。但也不是完全的绝对。如果选择顶端的话，就要在顶端放开选择杀菌灯的照射位置，不过这样的效果往往还是没有放在底部的好，因为照射的时候就要考虑到紫外线透射水的性能了。所以建议选择浸没式的紫外线杀菌灯来进行鱼缸消毒杀菌无疑是一种好的选择，综合因素都比较好。
每天使用杀菌灯约两个小时。让它长时间保持开放会以对鱼缸中的有益细菌产生一定的影响，同时缩短它的使用寿命。如果鱼缸里放的是治疗鱼病的药水，请务必关掉杀菌灯，这是为了避免紫外线和药物的不良反应。
人类的眼睛不应该长时间地盯着杀菌灯。杀菌灯的紫外线很厉害，大家要正常注意眼睛。杀菌灯的使用寿命一般在一年左右，用了一年后，虽然还在亮着，但效果不如以前，建议大家一般一年左右更换一次杀菌灯管是比较合适的。
现在水族行业设计的杀菌灯已经从最早的裸灯发展到配合定时器，再到现在的自带定时功能，就是让鱼友可以根据鱼缸的实际状况来设定杀菌灯的工作时长。
正常情况下，杀菌灯一般的建议使用时长是1.5—3小时，配合定时开关可以完美控制使用时长。遇到一些特殊的情况，例如水体“暴菌发白”、“绿水”等可以适当延长使用时间，以达到水体净化的效果。
有些鱼友杀菌灯是常年不关，天天开着，以为对水体更好好处，其实这样做不仅会缩短杀菌灯的使用寿命，浪费电，还会消灭很多有益菌群。杀菌灯杀菌是无差别的，它并不会分别细菌是有益还是有害，只要在它的能力范围内，统统消灭。
正所谓物极必反，没必要追求完全无菌的环境，事实上自然状态下，也没有完全无菌的环境，有的只是菌群的共生平衡。杀菌灯也只能消灭它能力范围的细菌，不要过度神话它。因此定时开关杀菌灯是很有必要的。
如果买不到自动控温设备，对于大鱼缸，可以直接采用电热管来保温。电热管由于不间断供热，无法自动控温，因此，鱼缸一定要够大，水装得多，电热管的功率要小些，要达到持续供热而不烧热水，否则，不但耗电大，还要做鱼汤了。如果有人工现场监护，则可以不在乎这些。此外，买的电热管质量要过关，不然烧坏了鱼儿要冷死，漏电了也要电死鱼儿。为了防止电热管把鱼儿烫伤，用一个容器装水，再把电热管放容器里，把容器放鱼缸里，这样还可以一定程度上防止鱼缸的水过热。