相对来说应该就是技术方面的进步吧，其他方面也很难做出比较，因为它们的任务是不同的。
①载人飞船将采用自主快速交会对接的方式，首次径向停靠空间站；
②届时中国空间站将实现核心舱、2艘货运飞船、1艘载人飞船共4个飞行器组合运行；
③航天员将首次在轨驻留6个月；
④中国女航天员将首次进驻中国空间站，王亚平将成中国首位出舱的女航天员，神舟十三号乘组将包括中国首次出舱的男女航天员；
⑤在神舟十二号任务的基础上，进一步开展更多的空间科学实验与技术试验，产出高水平科学成果；
⑥实施任务的飞船、火箭均在发射场直接由应急待命的备份状态转为发射状态。
这些不同，也是我们将面临的挑战。为中国航天加油！
按计划，神舟十三号飞船入轨后，将采用自主快速交会对接模式，对接于天和核心舱径向端口，与天和核心舱及天舟二号、天舟三号货运飞船形成组合体。航天员进驻核心舱，按照天地同步作息制度进行工作生活，约6个月后，搭乘飞船返回东风着陆场。对空间站关键技术验证阶段各项任务完成情况进行全面评估后，将转入空间站建造阶段。
空间站建造阶段规划实施6次飞行任务，①首先发射天舟四号货运飞船，运送补给物资，为随后实施的神舟十四号载人飞行任务做准备；②神舟十四号乘组在轨驻留期间，将先后发射问天实验舱和梦天实验舱，与天和核心舱对接，进行舱段转位，在2022年底前完成空间站三舱组合体建造；③随后实施天舟五号货运补给和神舟十五号载人飞行任务，神舟十五号乘组将与神舟十四号乘组开展在轨轮换。
对空间站状态进行全面评估后，转入空间站应用与发展阶段。后续，将择机发射巡天空间望远镜，与空间站共轨长期独立飞行，开展巡天观测，短期停靠空间站进行补给和维护升级。
据国家航天局最新消息，神舟十三号和十二号虽然在结构上没有较大的改变，但是在任务上有5大变化：
第一，由于天舟二号仍然对接着空间站，因此神舟十三号抵达空间站之后，将形成4个飞行器组合运行的壮观局面，即天舟二号、三号、神舟十三号和核心舱形成组合体，让空间站的在轨质量有了较大的提升。
第二，神舟十三号将首次以径向自主对接方式停靠空间站，所谓的径向对接是指载人飞船从空间站的下方垂直向上对接，与以往的水平方向对接有很大的不同。
第三，航天员驻留时间从3个月增加到6个月，中国女航天员王亚平将首次进驻中国空间站。
第四，在空间科学实验方面将有较大的提升。
第五，在神舟十二号发射之前，神舟十三号就已经就位，因此神舟十三号将从应急备份的状态转为发射状态，此后载人航天任务以此类推。
滚动备份的发射模式
神舟十三号和天舟三号是空间站第二轮有人驻留的配套工程，但是两艘飞船的制造时间和运抵文昌的时间不一致。
神舟十三号及长二F遥十三火箭组合体在神舟十二号发射前就已完成了发射场的总装和测试，同时完成了推进剂加注前的所有准备工作，达到随时可以起飞的状态。
这是载人航天工程实施的滚动备份发射模式，即发射一发、备份一发。
为了防止空间站或载人飞船遇到故障等紧急情况，无法安全将航天员带回地面时，这时马上使用备份火箭实施快速发射救援，将轨道上的航天员接回。
自神舟十二号起，开始采取这种发射模式，这意味着神舟十二号和十三号是同时建造、同时出厂、同时进场，而且先进行的是神舟十三、遥十三火箭的测试，在确定备份火箭状态正确后，才对遥十二号火箭进行测试。
以此类推，这次发射神舟十三、遥十三火箭之时，神舟十四号和遥十四号火箭将成为备份。承担备份应急发射任务的遥十四火箭，具备8.5天的应急发射能力，以最快速度进入轨道实施救援。
由于神舟系列是载人飞船，采用滚动备份的发射模式有利于确保航天员的生命安全，但承担货运任务的天舟系列飞船，则不需要采用这种模式。
神舟十二号当年返回地球的时候，从脱离空间站开始，减速过程用了27个小时，绕地球18圈，返回舱脱离后到落地用了49分钟，一共用了28.3个小时成功降落。
而现在的神舟十三号只会绕地球5圈，计算用时差不多7.5个小时，降落过程原理是一样的，所以返回舱从脱离到落地也是用49分钟，加在一起约有8.3个小时，这说明神舟十三号的降落时间要比神州十二号的降落时间整整少了20个小时，神州十三号有什么黑科技呢？
其实要想加快降落速度，最重要的就是要让飞船在一定程度上尽快减速，这就需要推进舱的动力足够大。除此之外，还有一个比较重要的点，那就是推进舱的点火速度要快，这两个问题解决了，飞船的降落速度就可以提前。
神舟十三号搭载的新“黑科技”就是解决这个两个问题的，它的名字也非常直白，就叫做“快速返回系统”，通过各种系统协同作战，调节飞船推进舱的工作，让飞船的点火速度更快，减速效率更高，飞船的降落也就快了起来。
那么为什么这样做呢？这其实也算是航天器科研中的知道重要问题。以现在的角度来看，航天器的降落可以在一定程度上保护三位航天员的安全；如果把目光放长远开看，这也算是我国航天器事业的一个重大进步，在这些科研成果的摸索过程中，也可以完善我国对航天器的研究，为以后真正的“星际旅行”等工作进行了铺垫。
神舟十三号任务有六大不同：一是载人飞船将采用自主快速交会对接的方式，首次径向停靠空间站；二是届时中国空间站将实现核心舱、2艘货运飞船、1艘载人飞船共4个飞行器组合体运行；三是航天员将首次在轨驻留6个月，这也是空间站运营期间航天员乘组常态化驻留周期；四是中国女航天员将首次进驻中国空间站，航天员王亚平也将成为中国首位实施出舱活动的女航天员，而神舟十三号乘组也将包括中国首次出舱的男女航天员；五是在神舟十二号任务的基础上，进一步开展更多的空间科学实验与技术试验，产出高水平科学成果；六是实施任务的飞船、火箭均在发射场直接由应急待命的备份状态转为发射状态。
空间站在轨建设分为关键技术验证和建造两个阶段实施，神舟十三号任务是关键技术验证阶段的决胜之战、收官之战，也是空间站在轨建设过程中承前启后的关键之战。林西强说，通过神舟十三号任务，将更加全面地考核工程各系统执行空间站任务的功能性能，以及系统间的匹配性与协调性。神舟十三号任务结束后，将组织进行全系统综合评估，满足要求后转入空间站建造阶段。
随着航天事业的发展，第二批中国空间站的客人已经成功进入，为中国的航天事业付出了巨大的贡献，2021年6月17日神舟十二号登入太空，2021年10月16日神舟十三号登入太空，两次飞行离得如此近，那跟神舟十二号相比，神舟十三号有什么新特点呢？
据航天局报道，神舟十二号和神舟十三号在结构上并没有突出的改变，但是任务上有五大改变。
第一大改变，因为天舟二号依然对接着空间站，所以神舟十三号在抵达空间站之后，将形成的4个飞行器，组合运行的壮观局面，也就是天舟二号、三号、神舟十三号和核心舱形成组合体，让空间站的在轨质量有了较大的提升。
第二大改变，神舟十三号将首次以径向自主对接的方式向空间站停靠，所谓的径向对接是指载人飞船从空间站的下方垂直向上对接，与以往的水平方向对接有较大的不同。
第三大改变，航天员驻留的时间从神舟十二号的3个月增加到6个月，中国女航天员王亚平也将首次进驻中国空间站，这是人类航天事业中的一大跨步。
第四大改变，空间科学实验方面会有较大的提升空间。
第五大改变在神舟十二号发射之前，神舟十三号就已经就位，因此神舟十三号将从应急备份的状态转为发射状态，此后载人航天任务以此类推。
其实跟神舟十二号相比，神舟十三号主要任务是集中在对空间站进行长期驻留的技术验证方面，测试相关设备长时间工作的可靠性，为人们在太空安家的梦想做进一步的测试