不可以：在异地申请办理港澳通行证，必须有当地的居住证及当事人的身份证才可以办理，只有户口本和身份证，没有居住证的，不能办理。
异地（外地）户籍办理港澳通行证的资料（内容来源：
http://leaders.people.com.cn/n1/2016/0330/c58278-28236434.html）：
1，从4月1日起，实施居住证制度的县级以上城市，居住证持有人可凭本人身份证和居住证，在居住地的县级以上公安机关出入境部门，申办普通护照等因私出入境证件。
2，公安部委托居住证持有人居住地的公安机关出入境管理部门代其户籍地公安机关出入境管理部门接收申请材料，并制发出入境证件，出入境证件申请仍由居住证持有人户籍地公安机关出入境管理部门审批。
3，公安机关出入境管理部门将在受理申请后的30日内签发出入境证件。
4，被告知不予签发出入境证件的申请人，仍然享有在户籍所在地申请行政复议或者提起行政诉讼的权利。
5，对于弄虚作假骗领出入境证件的申请人，公安机关将依法处理。