1、研究方法不同
自然地理：自然地理研究方法更多利用实验、数据分析、野外实地考察或卫星数据等。
人文地理：人文地理常用问卷法、访谈法等，做社会调查和质性分析。
2、学科侧重点不同
自然地理： 自然地理更加关注自然地理环境，包括自然地理要素及分布，自然现象规律与演变等。
人文地理： 人文地理更关注环境中的人，人的行为特征、区域经济发展、区域交通、产业分布等。
3、结论不同
自然地理： 自然地理中的结论，确定性强，多需要教师解释，用教师的话说，叫“有讲头”。
人文地理： 人文地理中的结论，确定性不强，主观色彩浓，很多结论无需教师解释，需要学生自己去感悟、体验。