祁连矿藏资源丰富，被著名的地质学家李四光称为"中国的乌拉尔"，主要有石棉、煤炭、铅锌、锰铜、石英石等40多种500余处矿点。祁连石棉储量大、棉质好，素有"味精棉"之称，可与加拿大魁北克石棉相媲美，是全国唯一可湿法生产的优良棉种；祁连是青海省重要的产煤区，煤炭储量大、煤质好.
探明黑色金属有铁、锰、铬，其中中型矿床2处、小型矿床8处、矿点16处，储量3948.4万吨，品位36.7 锰矿
3～43.74；锰矿点7处，储量10万吨，品位15.96～52.13；铬大型矿床1处、小型矿床3处、矿点34处，储量60万吨，品位4.57~51.19。有色金属有铜、铅、钴、锌、镍、钼、汞、锑等，其中：铜、铅、锌中型矿3处、小型矿1处、矿点16处，储量54.88万吨，品位铅9.75～15.75%、铜2.13%、锌5.77%；贵重金属有铂族、金、银，其中：岩金矿点3处，品位0.2～1.2克/吨；稀有金属铌、钽；分散元素矿产镓、镉、硒；放射性矿产铀；燃料矿产煤，分布较广，储量3.6亿吨，品种较多，品质较好；冶金辅助原料矿产有菱镁矿、白云岩、硅石；化工原料非金属矿产磷、黄铁矿、蛇纹岩、砷、重晶石；建材非金属及其他非金属矿产有石棉、石膏、石灰岩、滑石、大理岩、粘土、含钾岩石、宝（玉）石等，其中：石棉主要分布在小八宝～双岔沟，矿带长约150公里，储量1740万吨，居全国第二位，石棉理化性能独特，耐高温、易劈分、纤维柔软、机械强度高、纯度比例大、不易腐蚀，是生产石棉保温制品、磨擦制品、纺织制品、水泥制品、橡胶制品的最佳原料，祁连是我国湿法生产优质无尘成浆棉的重要原料基地区，享有"味精棉"美誉，宝玉石：分布较广、品质佳、又称"中国翠"。 祁连县现已开发利用的矿产资源主要有石棉、宝玉、煤、铬、铁、铜、锰、铅、锌，具体开发情况为：石棉，年处理原矿石12万吨，主要产品有手选块棉、机选棉绒水泥制品专用棉、磨擦材料专用棉、湿纺石棉纱等；宝玉石资源开发属小规模开发，主要开发企业祁连县翠光宝玉石开发公司为小型民营企业，企业主要产品有酒杯、餐具、人物造型、动物造型等；煤炭资源年开发能力为30万吨；铬铁资源主要开发企业祁连县玉峰矿业公司年产铬铁原矿7000吨、精矿粉5000吨；铁、铜、铅、锌等有小规模开发。 矿产资源开发条件较好的项目有：⑴龙孔铁矿探采，储量C2级359万吨，品位28.76％；⑵大沙龙铁矿探采，储量级693万吨，品位29.33％；⑶小水沟铁矿探采，储量1429万吨，品位32.43～43.74％；⑷小八宝南山铁矿探采，储量85.9万吨，品位全铁30％左右；⑸红柳沟铁矿探采，储量C2级65万吨，品位全铁平均29.38％。⑹边麻沟锰矿探采，储量C2级1万吨，品位28%；⑺清水沟锰矿探采，储量C2级3.3万吨，品位29.3～42.2%；⑻卧龙沟锰矿探采，储量3.8万吨，品位17.96～35.6%；⑼大柳沟锰矿探采，储量1万吨，品位23.3～20.53%；⑽冰沟锰矿探采，储量C2级1.8万吨，品位12.23～14.72%；⑾辽巴台铜铅锌探采，储量14016吨，品位铅1.5～15%、锌3.9～29%；⑿下沟铜铅锌探采，储量3.09万吨，品位0.9～6.8%；⒀年产1万吨轻质氧化镁；⒁年产3万吨石棉绒；⒂咂哈拉掌年产5000吨玉石矿。
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