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基于细菌16srdna测序的菌群分析一般可准确鉴定到何种分类水平
如题所述
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第1个回答 2014-02-14
种。但有时如果基因bank无有此种细菌的16srdna数据,则也可能是鉴定到属。
相似回答
通过保守序列
测序
来
鉴定
微生物,可靠性有多少
答:
16S rDNA测序
即是对16S rDNA特定可变区(可选择单可变区或是多可变区)进行PCR扩增,再结合高通量测序和生物信息
分析
,帮助研究人员进行大规模鉴定群落组成,表达丰度,以及开展系统进化分析的方案。该方案因其无需分离培养细菌,实验操作简单,并可大规模鉴定特定生境中全部
菌群
而成为研究微生物群落多样性的...
为什么现在放线菌
测序
确定
分类
地位用
16S rDNA
答:
Woese等[3]与Olsen等[4]基于对
16SrDNA的分析
构建了现已被分认的全生命系统进化树,越来越多的细菌依据16SrDNA被正确分类或重分类,尤其是许多环境中的细菌[5。6],如Funke等将棒杆菌依赖细胞毒性1组及类似棒杆菌重新确定为放线菌的一个新种,即钮氏放线菌中,Bennasar等通过比较14株施氏假单胞菌的...
16S
rRNA序列的功能是什么?
答:
16SrRNA是一种核糖体RNA,存在于细胞质中,在细菌、古菌和一些真核生物中广泛存在。
16SrDNA
则是其对应的基因序列,存在于染色体中,具有遗传信息,可以通过PCR扩增并进行序列
分析
。6.16SrRNA定量PCR技术 利用16SrRNA序列特异性敏感的PCR方法,可以对微生物群落内不同种类
细菌的
丰度进行定量分析。该技术通常...
求分子克隆具体实验步骤一份~~多谢各位大侠啦~
答:
随着分子生物学的迅速发展,
细菌的分类鉴定从传统的表型、生理生化分类进入到各种基因型分类水平
,如(G+C)mol%、DNA杂交、rDNA指纹图、质粒图谱和16S rDNA序列分析等。细菌中包括有三种核糖体RNA,分别为5S rRNA、16S rRNA、23S rRNA,rRNA基因由保守区和可变区组成。16S rRNA对应于基因组DNA上的一段基因序列称为16S...
16s
rna
测序
技术与高通量测序技术有什么区别?
答:
相对于传统的测序方式,高通量测序能对复杂样本进行深入
分析
,发现更多生物信息,尤其在宏基因组测序中显示出了独特优势。综上,
16SrDNA测序
技术侧重于微生物
的鉴定
,依赖于其独特的DNA序列进行物种分类,而高通量测序技术则是一种先进的测序手段,能够高效地对大量样本进行测序,适合于复杂样本的深入分析。
基因
测序
时otu和 归类操作一样吗
答:
可以在不同分类学
水平
下作图
分析
。饼状图(图6)在某一分类学水平上,不同
菌群
所占的相对丰度比例。不同颜色代表不同的物种。5. 样品OTU 分布Venn 图用于统计多个样品中共有或独有的OTU数目,可以比较直观地表现各环境样品之间的OTU 组成相似程度。不同样品用不同颜色标记,各个数字代表了某个样品独有或几种样品共...
16SrDNA鉴定的
介绍
答:
英文名称是16S ribosomal DNA identification,应用有细菌种属鉴定。细菌rRNA(核糖体RNA)按沉降系数分为3种,分别为5S、16S和23S rRNA。
16S rDNA
是细菌染色体上编码16S rRNA相对应的DNA序列,存在于所有细菌染色体基因中。16S rDNA是
细菌的
系统分类研究中最有用的和最常用的分子钟,其种类少,含量大(约...
细菌鉴定
除了生理生化反应之外,还有哪些鉴定反应?
答:
2、分子鉴定:提取纯菌的DNA样品,对
16SrDNA
进行扩增,测序,将测序结果在NCBI网站上进行BLAST,可初步确定至“属”一级分类单元。3、理化
分析
:进行碳氮源利用、产酶特性、代谢产物等鉴定特征的检测,检测项目需要根据前两项分析的结果,结合《伯杰氏系统细菌学手册》进行。一般需要检测至少20项以上的理化...
请问
16s
rRNA在生物体中的功能是什么??
答:
事实上这三种编码原核生物核糖体RNA的rRNA基因序列在进化上都是保守的,都可以拿来进行进化
分析
,但基于上述原因一般都用
16S
rRNA序列。
鉴定细菌
到种一般都采用16S rRNA和传统生化指标相结合的方法 附1:首先如果你的菌株是自然界中分离得到,就只能
鉴定到
种,不能鉴定到株,因为多多少少和其他株系的...
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16s rna基因测序
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通过16srDNA鉴定细菌的疑惑
您好,我想问下关于16srDNA测序的问题~
什么是16S rDNA基因序列分析
求助:细菌16srDNA鉴定时PCR通用引物