蓝藻(拉丁学名:Cyanobacteria),也被称为蓝菌门,是通过光合作用获取能量的细菌门。蓝菌门下物种又称蓝细菌、蓝绿菌、蓝藻或蓝绿藻,当中包括发菜、螺旋藻等生物。蓝藻是单细胞生物,没有细胞核,但细胞中央含有核物质,通常呈颗粒状或网状,染色质和色素均匀的分布在细胞质中。该核物质没有核膜和核仁,但具有核的功能,故称其为原核(或拟核)。在蓝藻中还有一种环状DNA——质粒,在基因工程中担当了运载体的作用。和细菌一样,蓝藻属于“原核生物”。根据内共生理论,在植物和真核藻类发现的叶绿体从蓝细菌祖先通过内共生进化而来的。
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