R语言生存分析之单因素cox回归及其森林图绘制

Question

如题所述

Answer 1

首先，需要导入数据并加载survival包。

在样本数据中，包含基因表达水平（gene）和两列生存数据：生存结局（surstat）和生存时间（surtime）。

接下来，进行单因素cox比例风险模型生存分析，分析每个基因表达水平与样品所属个体生存预后的相关性。

分析完成后，得到名为outResult的数据。

从outResult中提取有统计学意义的基因的表达数据，并输出，以供后续使用。

为了展示分析结果，绘制森林图。运行特定代码，可以得到一个名为UniCoxSurForestPlot.pdf的PDF格式森林图。

森林图代码解释中提到，可以不执行绘图命令，而是逐步查看绘图过程，以帮助理解代码。

如果将plot函数中的axes参数从F设置为T，即显示坐标及边框，所得到的图形如下：

该森林图实际上是由两个组合而成的图形。