（1）原料与容器的处理
①水质的处理：水的总硬度（即总碱度以CaCO3计）要达到＜50毫克/升，如果水质不符合标准，钙、镁离子含量超标，会引起蛋白沉淀。
②原料豆的处理：生产豆奶用大豆首先要经过清选，无杂质、无虫蛀，并且使用前要进行脱皮处理，因为豆皮主要成分为纤维素，纤维素不溶于水，在豆奶中会逐渐沉降，一般豆奶底部的一小层如不是腐败沉淀便是豆皮纤维颗粒。
③豆奶包装物的处理：有大部分豆奶厂采用500毫升玻璃瓶装豆奶，这样的包装物在使用前应用碱水浸泡30分钟后用经过软化的水冲洗干净或用紫外灭菌方法消毒。瓶盖的处理同样，这样以防包装物上残留杂质及大量微生物群。
（2）工艺条件的控制
①热处理：煮浆是豆奶生产中重要一个环节，煮浆一方面使大豆蛋白空间结构破坏，氢键断裂，多肽链由卷曲而伸展，提高了大豆蛋白的溶解性；另一方面也是对一些抗营养因子，如脂肪氧化酶、异蛋白酶抑制剂等钝化，去除豆腥味与有害因子。但由于大豆蛋白本身的热变性性质，因此温度一般控制在85℃左右较好，保温15分钟。
②均质可以提高豆奶稳定性：在豆奶生产中高压均质是不可缺少的一个步骤，料液经过高压均质提高乳化性，使蛋白质粒子与水分子充分水化，构成更加稳定体系，同时也改变了豆奶颜色，使之呈乳白色。在高压下能抑制一般酵母菌发酵作用。生产中通常均质条件采用45兆帕，10分钟处理。
③pH的调节：为了提高豆奶稳定性，生产中一般都将料液pH调至中性，以远离大豆蛋白等电点，促进大豆蛋白解离，提高起水化作用，同时也满足了口味需要。一般生产中将料液pH值控制在7。
④杀菌方式的采用：杀菌的目的是杀灭微生物以保证豆奶货架期。通常豆奶罐装后采用高温瞬时杀菌。杀菌时温度、时间的选择要考虑到大豆蛋白的热变性，一般采用121℃，15分钟。
此外，值得一提的是压盖工序，压盖必须要严，以防在杀菌时暴沸或漏气或保存时受外界侵入微生物污染。
（3）卫生管理
豆奶生产中卫生条件也不可忽视，即使工艺严格控制，若卫生差，在某个环节污染，为微生物的生长繁殖创造了条件，因此在原料运输、贮藏以及生产加工的各个环节都要加强卫生管理，严格执行各项卫生制度，特别是机器、用具的清洗消毒。工艺上合理控制温度，尽可能实现生产的连续化、密闭化和自动化，杜绝因微生物生长繁殖引起腐败现象。
（4）工艺配方的优用
为了进一步提高豆奶的稳定性，我们可以采用添加乳化剂与增稠剂的方法，实验表明将0.04%黄元胶和0.05%海藻酸钠混合加入豆奶中，稳定效果非常好，达到3个月的货架期要求。
另外，某些厂家生产强化豆奶，在豆奶中添加钙、锌等离子，这些离子的添加要适量，否则会使蛋白凝聚沉淀。
总之，豆奶的稳定性问题是豆奶生产中的重要问题，要严格按工艺要求加工生产，排除各种影响因素的作用，生产出合格产品。