波哥大的机场设施分为两个主要航站楼，首先是埃尔多拉多航站楼，它负责处理所有国际航班和除阿维安卡航空公司以外的所有国内航班。航站楼设计为上下两层，一层设有购票和办票柜台、移民局、海关等服务区域，而楼上则是信息显示屏、候机区以及出境手续办理的地方。
埃尔多拉多航站楼分为两个大厅：国内客运和国际客运。国内大厅拥有11个登机门，还有5个专为支线航班设计，国际大厅则设有9个登机门。航站楼内部有5.4万平方英尺（5000平方米）的乘客区域，为旅客提供各种服务，如旅行社、餐馆、书店、工艺品店、ATM、免税商店和通信设施。并且，乘客可以在国内和国际到达层享受到旅游信息办公室和市内地面运输服务，24小时出租车服务也十分便捷。
另一个航站楼，空中普恩特，是专为阿维安卡航空公司国内和地区航线服务的私营设施。初期服务范围有限，但经过2006年10月的750万美元装修升级后，其处理能力提升至每年440万人次，每天服务超过120个航班。空中普恩特航站楼面积为4416平方英尺（410.3平方米），设有14个国内登机口，还提供购物场所、长途电话服务、出租车、ATM、餐厅以及众多书店和礼品店等便利设施。
机场的民用航空特别管理处在机场土地上新建了一座航空管理楼，原位于主航站楼的第四层。这一变动旨在优化机场管理和服务效率。
波哥大机场又名埃尔多拉国际机场，位于南美洲哥伦比亚中部的首都波哥大西北，是该国最大的国际机场，也是南美洲第四大机场，同时也是南美洲货运量最大的机场。