毕业证书相同，只是录取方式有差别。
1、条件不同：自主招生主要考察学生的综合素质，与应试教育有很大不同。现已在很多重点大学开始实行。参加自主招生考试，可增加录取的可能性。因为只要自主招生考试通过，就可以享受降分录取的优惠政策，前提是一志愿报考本校。一般只有一个。因为自主招生考试时间一般是相同的，则只能参加一个学校的自主招生。反正在北京是这样。一般来讲，参加自主招生，必须参加高考。两者是不矛盾的。
2、要求不同：自主招生择校原则一般有两种，一是选择正常的比赛条件，以裸成绩排名不能达到，依靠自主招生分数进入学校。二是选择正常的比赛条件，以全裸得分排名，才进入这所学校。2015年，独立招生进入考场。
3、压力不同：自主招生录取后学生可以继续参加普通高考，如果考上本科同样能被本科院校录取。
自主招生录取等同于高考录取，对考生来说等于多一次机会。参加自主招生被录取的考生，等于已有保障，减少高考压力，更有利于发挥自身水平。
参考资料来源：百度百科-自主招生
参考资料来源：百度百科-高考录取
毕业证书是一样的。进去方式不同。
1、灵活性不同：自主招生和统招的区别在于一个灵活性，自主招生可以是你选学校和学校选你，而统招只能是以分数来选择学校。
自主招生：学生可以上阳光高考平台先提交相关的报名条件资料之后，同时递送材料到该校（大多数的高校限报三所）。经该校审核后，会通知入选学生进行笔试面试，面试通过后，学校会根据学生成绩择优录取，待学生确认之后，则该生正式被该校提前录取，后只需高考考到教委统一划定的‘提前录取最低控制分数线’即被正式录取。
统招：学生填写志愿表（分为零志愿、名额分配志愿、中高职贯通志愿、一到十五志愿），参加全市统一的中考后，根据所填志愿和实际成绩进行录取。自主招生没有成功不影响统招的顺序，若已被提前录取，则达到最低控制必须进入该校，若未达到，所填统招志愿表自动生效，按顺序进行录取。
2、优势不同：统招本科的含金量比较高，社会认可度也高于本科。在报考公务员和事业单位的时候，一般要求统招本科。
3、要求不同：从2015改革后，高校自主招生都安排在高考后举行了。自主招生通过的同学可以获得降分录取、加分选专业等优惠（视具体情况而定）自主招生的考试卷由高校或高校联盟独立出题，独立批卷，报名也是独立报名的。
一般分为笔试和面试阶段，理科生通常考英语和数学，大部分学校还有语文。物理化学生物采用合卷或者选答一科，视不同学校在不同省份有差异。一般有自主招生的学校都是211以上的学校，相对条件不错。不过考试的考点一般只在省会才有，甚至两省公用一考点，个别要到学校去考试。
参考资料来源：百度百科-自主招生
参考资料来源：百度百科-高考录取
本回答被网友采纳自主招生，是扩大高校自主权、深化高招改革的一项重要举措。通俗地说，自主招生给了高校更多的招生自主权，使高校不再完全按照高考成绩排队录取考生，改变了以往一张考卷定终身的现象。
各个高校实施自主招生的情况不完全相同，目前大体可分为三类。第一类是高校拿出招生计划总数的5%进行自主招生。高校通过测试来确定自主招生入选考生名单，考生入选后还要参加全国统考，在录取时可享受一定条件的优惠。第二类是复旦大学、上海交通大学在上海地区实行的自主选拔录取。这两所大学录取改革最大的突破在于面试结果即能决定录取与否。已经被自主录取的考生，也要参加高考，但高考成绩只作为录取的参考。目前，这种自主选拔只针对上海考生。第三类是高职院校的自主招生。近年来，上海、北京等地区的部分高职院校实行自主招生，如2006年北京信息职业技术学院、北京培黎职业学院、北京汇佳职业学院在北京实行了自主招生。考生参加这些院校自主招生测试合格后，可直接被录取，不用再参加高考。
这三类自主招生有共同之处，也有区别，考生和家长要注意区分。限于篇幅，下面主要介绍第一类自主招生。
自主招生申请条件有所降低
高校在实施自主招生时，对考生都有相应的条件要求。一般要求考生在某些方面具备突出的能力，如具有超常的创新和实践能力，在文学、艺术、体育等方面有特殊才能，学科竞赛获奖，综合素质名列前茅等，而且是应届高中毕业生。申请时，一般采取学生个人申请和中学推荐相结合的方式。
从北大、清华、中科大等几所已经公布自主招生方案的高校来看，这几所高校自主招生申请条件都有所降低。如北大取消了自主招生申请者是重点中学毕业生的限制，普通中学毕业生也可申请。清华将具有乒乓球、武术、击剑、网球、手球、棒球、棋类等体育特长的考生也纳入到自主招生中来。中科大则只要求考生是应届高中毕业生，并且学习成绩优秀、综合素质突出，对是否竞赛获奖等没做硬性要求。
当然，申请条件的降低并不意味着高校自主招生门槛的降低，申请者还要通过招生高校的测试，才能获得自主招生候选资格。
自主招生要过三关
参加自主招生，可以获得一定的优惠，但自主招生的竞争也很激烈，对考生来说，想通过自主招生被高校录取，要过三道关。
第一关是申请材料审核。高校都会对自主招生材料进行审核，在众多的申请者中选取部分考生进行测试。对于考生来说，要按照高校要求，将申请材料准备齐全。除了申请表之外，申请材料还可以包括获奖证书复印件、个人陈述、其他申请资料等。获奖证书可以是考生在高中阶段获得的各种奖励证书。个人陈述主要是让高校更加了解你，内容可以包括你参与的一次重要活动、取得的成绩、曾经遇到的困难等，或者介绍本人的性格、习惯、优缺点，还可以介绍自己在大学期间的计划等。另外，考生还可以准备1至2封推荐信，内容包括推荐人的姓名、与学生的关系、推荐人联系方式以及对申请者的评价等。如果申请材料过不了关，就参加不了高校自主招生测试，也就失去了自主招生机会，所以申请材料是十分重要的。需要考生特别注意的是，申请材料一定要真实，如果弄虚作假，不但会被取消录取资格，还有更严厉的惩罚措施。
第二关是高校自主招生测试。各高校一般会单独或联合组织自主招生测试，如清华、北大等高校通过各自的冬令营来选拔自主招生候选人，北科大、北交大、北邮、北林大、北化工2006年则实行自主招生五校联考。自主招生测试一般分为笔试和面试。无论是笔试还是面试，都不同于高考，试题灵活，涉及面广，主要看考生平时的积累。如某高校的一道试题是：“神六”发射的过程中，哪些现象能用物理原理解释？这是一个开放性的问题，没有标准答案，只要考生能言之成理，都可以得分。
第三关是统一高考。考生通过高校自主招生测试后，高校会同考生签订协议，考生要参加统一高考，一志愿报考该校，高考分数在该校提档线下20分即可被录取。特别优秀的考生经批准后，还可享受更优惠的政策。因此，无论考生是否通过了高校自主招生测试，都要继续努力学习。往年，有的考生通过自主招生测试后，放松了学习，结果高考成绩达不到高校录取要求。也有的考生虽然没能通过自主招生测试，却通过努力最终考上了理想的大学和专业。