县委办公室和县政府办公室区别如下：
一、内设机构不同：
1、县委办公室机构如下：
文秘组、综合组、县委督查室、县委保密委员会办公室（县国家保密局）、政研信息室、后勤组、县委机要室等。
2、县政府办公室机构如下：
行政科、、秘书科、督办科、法制科、信息科、外事办等。
二、工作职能不同：
县委办公室职能如下：
1、协助县委领导处理县委日常工作，协调乡镇和部门工作，沟通上下左右联系；
2、负责县委日常文书的处理、县委领导同志公务活动的组织安排、县委各类会议的组织工作；
3、负责县委文件、文稿的起草、批办、审核和印发工作；
4、围绕县委中心工作开展调查研究，及时准确地向县委领导和上级党委反映各方面的实际情况，并提供切实可行的建议；
5、及时收集、筛选、综合整理各类情况，全面准确地为县委领导、上级党委报送信息；
6、围绕县委重大决策和工作部署，进行督促检查，做好领导重要批示件、新闻舆论批评和群众反映的突出问题的查办工作；
7、负责全县党政密码通信、密码管理和密码保密及全县商用密码的管理工作；中央、省委、市委、县委文件和县级重要机密件的传递，领导机要专线电话的管理工作；
8、负责中、省、市领导的接待工作，负责各省（市、区、县）党委及办公室来客的接待工作；
9、主管全县保密工作，督促、检查全县及驻本县单位、部队和企事业单位对《保密法》及其配套法规的贯彻实施情况；
10、承办县委领导和上级业务部门交办的其他工作。
县政府办公室职能如下：
1、承办州政府工作决策在我县的行政工作和县政府向州政府报告、请示的文稿起草工作，以及州委、州政府及其部门转由县政府办理的事项及反馈工作；
2、承办乡(镇)政府和县直部门报送县政府的请示、报告的办理、送审和报批工作；
3、负责县政府会议的准备和决定事项的督办、检查、反馈工作；
4、起草、送审、印发以县政府或县政府办名义制发的文件，检查乡(镇)政府和县直部门执行县政府决定、指示、文件的情况，并负责向县政府领导报告；
5、为县政府领导的重要报告和讲话提供文稿资料；
6、协调各部门工作，对有争议的问题提出处理意见，报县政府领导决定；
7、承担县政府领导决策所需的调查研究和信息工作；
8、根据领导指示，组织协调处理突发事件和重大事故；
9、组织、协调办理人大代表议案和政协委员提案工作；
10、负责办理人民群众来信来访工作；
11、负责县政府及县政府办公室电报、文件、函件、简报的收发、印制、清退、归档、保密和管理；
12、负责县政府值班工作；
13、负责县政府办公室的人事管理和思想政治工作；
14、负责县政府领导交待、安排的接待工作；
15、负责全县政府系统的行政执法、监督、应诉的规划和协调工作；
16、负责县政府外事、侨务工作；
17、办理县政府领导交办的其他事项。
扩展资料：
县委办公室是正科级单位，但县委办主任很容易升任县委常委成为副县级领导，并继续兼任县委办主任。
协助县委领导督促检查县委重大决策、重要工作部署的贯彻执行和落实情况，办理、检查县委领导和上级领导机关的批示件及交办事项的落实，及时了解和报告执行及办理中出现的新情况、新问题，负责县委全面日常工作。
县委办公室是县委的重要办事机构和综合职能部门、是县委工作运转、承上启下、联系左右和沟通内外的枢纽，具有参与政务、处理事务、履行服务三大职能。
县政府办公室是县政府综合管理全县经济建设和社会发展事业，主管县政府日常政务工作，实施行政指挥和监督，参与对国民经济进行宏观调控的职能部门。
政府办公室主任一般不是政府党组成员（有的地方可能特殊），但可列席县长办公会和县政府常务会议。其行政级别是正科级 。
参考资料来源：百度百科-县委办公室
参考资料来源：百度百科-县政府办公室
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前者属党系统，与中共中央是一路的；后者属政府系统，与国务院是一路的。