特殊病种一年最高限额能报销花费的90%。患者的具体情况不同，报销比例存在差异每个城市及地区呈现出来的实际情况具有一定差别，像来自农村地区的贫困患者，其报销补偿比例可达90%，但前提是必须建档立卡，能证明自己的贫困身份，达到条件之后才能享受此类报销。医疗机构的级别不同，报销比例也存在差别。
办理特殊病种流程以及相关材料：
1、携带既往病史资料（出院记录，化验单，疾病相关检查报告单等）至门诊医生就诊，符合条件的患者，由医生填写基本医疗保险特殊病种证明及门诊治疗审批表。
2、特殊病种审批表必须由二级以上定点医疗机构经治医师填写。
3、医院办理完结后，患者或家属携带病史资料，医保卡，身份证（未成年人持户口本）和1寸照片2张。及以上医院相关病史资料到户籍所在地的社保所申请，领取并填写申请表，审批表到当地社保局审批并盖章。
特殊病种有哪些：
特病病种有20多种，大致包括心脑血管疾病、呼吸系统疾病、消化系统疾病、血液病、内分泌疾病、精神障碍性疾病，以及恶性肿瘤等其他疾病等。
1.心脑血管疾病：冠心病、高血压、风湿性心瓣膜病，以及脑出血、脑梗死、蛛网膜下腔出血等脑血管意外后遗症。
2.呼吸系统疾病：如支气管哮喘、慢性支气管炎伴阻塞性肺气肿、慢性肺源性心脏病。
3.消化系统疾病：主要包括丙型肝炎、慢性乙型病毒性肝炎感染。
4.血液病：包括血友病、再生障碍性贫血、骨髓增殖病等血液病。
5.内分泌疾病：主要包括I型、II型糖尿病。
6.精神障碍性疾病：如精神分裂症、抑郁躁狂症、偏执性精神障碍。
7.其他：除以上疾病外，结核病、重度前列腺增生、系统性红斑狼疮、恶性肿瘤的放疗、化疗、镇痛治疗、肾功能衰竭病人的透析治疗，以及肝脏、肾脏、心脏瓣膜、肺移植、造血干细胞移植术后的排异治疗等也属于特病病种。
法律依据：
《中华人民共和国社会保险法》
第二十八条 符合基本医疗保险药品目录、诊疗项目、医疗服务设施标准以及急诊、抢救的医疗费用，按照国家规定从基本医疗保险基金中支付。
第二十九条 参保人员医疗费用中应当由基本医疗保险基金支付的部分，由社会保险经办机构与医疗机构、药品经营单位直接结算。社会保险行政部门和卫生行政部门应当建立异地就医医疗费用结算制度，方便参保人员享受基本医疗保险待遇。
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