在南京的二本大学包括：
1. 南京审计大学
2. 南京晓庄学院
3. 南京师范大学泰州学院等。
详细解释如下：
南京是中国高等教育的重要基地之一，拥有众多优秀的大学。其中，二本大学也占据了相当的数量。这些学校在教育质量、科研实力、校园文化等方面都有着优秀的表现。
南京审计大学是一所财经类二本学府，在国内享有较高的声誉。学校以审计专业为特色，同时其他学科如财经、管理、法律等也有很大的发展。南京晓庄学院则是一所以教师教育为主要特色的二本大学，同时也在文学、理学、工学等领域有所建树。另外，南京师范大学泰州学院也是一所二本学府，其在教育学、文学、理学等领域有着优秀的教育资源和研究成果。除此之外，南京还有一些其他的二本大学，如南京特殊教育师范学院等，这些学校也都在各自的领域有着突出的表现。南京的这些二本大学为当地和全国的学生提供了丰富的学习资源和就业机会。南京的高等学府以其高质量的教育和丰富的文化底蕴，吸引了大量的学子前来求学。此外这些大学的设置也是南京作为教育重镇的重要体现之一。随着时代的发展，南京的二本大学也在不断地进步和发展，为培养更多优秀人才做出了重要贡献。