夫妻双方各有一套房个税扣除可以选择一套按100%扣除或各自按50%扣除。
夫妻双方婚前各自拥有一套首套房产，在计算个人所得税时，可以选择以下两种扣除方式之一：选择一套房产，由购买该房产的一方按照首套房的贷款利息扣除标准全额100%扣除；双方各自对自己购买的房产按照扣除标准的50%进行扣除。无论选择哪种方式，一旦确定，在当年的纳税年度内不得更改。
个税的计算方式：
1、个税起征点：个人所得税的起征点是指个人每月收入达到一定金额后，超出部分才需要缴纳个人所得税；
2、税率表应用：个人所得税采用累进税率，不同的收入区间适用不同的税率；
3、综合所得计算：将工资薪金所得、劳务报酬所得等合并计算，以确定应纳税额；
4、专项扣除：包括子女教育、继续教育、大病医疗等专项扣除项目；
5、专项附加扣除：住房贷款利息、住房租金、赡养老人等专项附加扣除项目；
6、其他扣除：根据税法规定，还可能有其他合法扣除项目。
综上所述，夫妻各自拥有一套房产时，在计算个税时可选择一套全额扣除或分别扣除50%，但所选方案当年度内不可更改。
【法律依据】：
《全国人民代表大会常务委员会关于修改《中华人民共和国个人所得税法》的决定》
第三条
将第三条修改为：“个人所得税的税率：“（一）综合所得，适用百分之三至百分之四十五的超额累进税率（税率表附后）；“（二）经营所得，适用百分之五至百分之三十五的超额累进税率（税率表附后）；“（三）利息、股息、红利所得，财产租赁所得，财产转让所得和偶然所得，适用比例税率，税率为百分之二十。”
《中华人民共和国个人所得税法》
第二条
下列各项个人所得，应当缴纳个人所得税：
（一）工资、薪金所得；
（二）劳务报酬所得；
（三）稿酬所得；
（四）特许权使用费所得；
（五）经营所得；
（六）利息、股息、红利所得；
（七）财产租赁所得；
（八）财产转让所得；
（九）偶然所得。
居民个人取得前款第一项至第四项所得（以下称综合所得），按纳税年度合并计算个人所得税；非居民个人取得前款第一项至第四项所得，按月或者按次分项计算个人所得税。纳税人取得前款第五项至第九项所得，依照本法规定分别计算个人所得税。
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