在美国长大的查星宇（李克勤饰），因不满母亲改嫁，决定回到香港，与父亲查万里（秦沛饰）以及同胞弟弟查星宙（黄贯中饰）重聚。在父亲的安排下，星宇和星宙一同开始了中七的学习，他们的朋友圈也由此扩大，其中包括了李西西（梅小惠饰）、知识渊博的YY博士（黄家强饰）以及热爱舞蹈的徐翊（郭富城饰）。
查星宇性格活跃，好动不凡；而星宙则以学业优秀和品行端正著称。西西对爱情充满了浪漫的憧憬，YY博士则以其广泛的知识吸引着众人，徐翊的舞蹈才艺则为校园生活增添了活力。在这样的环境中，他们共同创造了充满乐趣的校园生活。
星宇与常欣然（余倩雯饰）之间充满了斗嘴的缘分，两人逐渐产生了微妙的情感。然而，星宇深知星宙对欣然的暗恋，为了成全弟弟，他选择了忍痛割爱，这导致了星宙与星宇之间产生了裂痕。随着大学入学考试的临近，学业与感情的双重压力考验着他们，他们将如何面对这些挑战？
《淘气双子星》讲述自小在美国生活的查星宇（李克勤）不满母亲改嫁，毅然返港，与父亲查万里（秦沛）及孖生弟弟查星宙（黄贯中）重聚。