当前我国基层党组织存在的问题：
一是个别党组织“一把手”角色定位不准，党建意识不强。表现为：个别党组织“一把手”把工作重心和主要精力放在业务工作上，忽视了支部书记的责任，对支部建设和党员管理用心不够，存在党建工作“说起来重要，做起来次要，忙起来不要”的现象；有的基层党组织负责人对党建业务不熟悉，找不到基层党建紧扣中心、服务大局的切入点和着力点，工作“算盘式”，拨一拨，动一动；有的尽管能够把基层党建同中心工作、业务建设结合起来，但在实际工作中开拓进取、迎难而进的劲头不足，成效不明显。
二是少数基层党组织抓党建工作被动应付，工作质量不高。表现为：传达学习上级指示敷衍塞责，满足于会开了，文件念了，领导讲话传达了，至于怎么领会精神实质，怎样统一“一班人”思想，如何结合实际贯彻落实，就没有下文；有的支部研究部署重要工作没有充分发挥集体智慧，用领导“碰头”代替集体领导，该集体研究的没有研究，该民主讨论的没有讨论；还有的支部图省事，怕麻烦，研究党建工作时，常以支委扩大会代替支委会，甚至随意简化党务工作程序，在一定程度上削弱了支部集体领导的作用。
三是个别党务干部对抓党建工作缺乏荣誉感，能力素质偏弱。少数党务干部对党务知识缺乏系统培训和基本了解，把不住规律，抓不住要点，抓党建工作往往是三分钟的热情；个别党务干部受市场经济和外部不良环境的影响，物质化倾向严重，总认为抓党务工作太虚，不如经济工作、业务工作来得实在，对抓党建工作缺乏荣誉感和价值认同；还有个别党务干部做群众工作的素质不强，缺乏妥善解决群众困难和积极应对棘手问题的能力，从根本上削弱了党组织的凝聚力和战斗力。
四是少数基层组织对党员的教育形式单一，管理监督乏力。教育方面，多数党内组织生活仍以读报纸、学文件为主，与工作实际结合不紧，形式单一枯燥，组织生活存在形式主义和随意性，党课教育存在简单化倾向，“三会一课”制度执行仍有差距；一些党支部没把落实组织生活制度当作教育管理党员的有效途径，党员汇报思想或参加党内讨论大话、套话、空话多，实话、真话、心窝话少；个别党组织对入党积极分子缺乏党的基本知识教育和经常性的培养，对入党愿望迫切一时又难以实现愿望的干部职工和基层群众，缺乏耐心细致的思想工作；在管理方面，对那些不自觉履行党员义务、不自觉参加党内生活、不主动交纳党费的党员缺乏严格有效的组织处理措施。民主评议党员，往往只是简单地划勾划叉，缺乏沟通和面对面评议；对一些有轻微违纪的党员，在处理上往往失之于宽，失之于软，导致一些问题长期存在，甚至扩大蔓延。
五是一些基层党组织落实党内制度有差距，机制运行不畅。表现在：部分基层党组织负责人，因身兼数职，既管党务又管政务，存在岗位职责不清、任务分工不明，抓不住工作重点，甚至忽略了党务工作；有的正副书记集体领导观念不强，民主集中制贯彻执行不自觉，遇事喜欢个人说了算，不想发挥成员的作用，甚至担心发扬民主不利于集中；党建考核机制有待完善，考核指标较为笼统，难以量化，且缺乏及时有效的监控措施和制约手段，导致党建考核操作性不强，在一定程度上影响了责任制的落实。
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