若团员证、团员档案同时遗失，原则上须持原毕业学校团委出具的证明(证实是团员，并写明何时何地入团)到团委补办。
以湖南工业职业技术学院为例，补办程序为：
1、团员填写《补办团员证、团员档案申请表》，团支部内部讨论，辅导员给予相应的意见。
2、各系（院）团总支收齐补办团员证、团员档案申请表，给予相应的意见。
3、请各系（院）团总支组织统计好名单和需补办的项目，填写《团员证补办登记表》、《团员档案补办登记表》，加盖系（院）章、收齐补办工本费（团员证、团员档案工本费均为4元/份），于上交至院团委办公室审核，同时领取空白的团员证、团员档案。
4、各系（院）团总支将各团支部填写完的团员证、团员档案收齐（贴好个人免冠一寸照片），交院团委办公室进行盖章。然后下发给各团支部，至此补办工作结束。
根据《中国共产主义青年团团员证管理暂行条例》第八章 团员证日常管理
第三十七条 团员遗失团员证，应及时报告团的组织，在确认无法找回时，由团的基层委员会办理补发手续，并在新证备注栏内加以说明。
扩展资料
团员档案的主要内容有包括人团志愿书、组织鉴定、团内奖励决定、团内处分的调查、本人检查和组织决定。
团员证：团员证是中国共产主义青年团团员团籍的证明。团员证的功能主要有七项：证明团员政治身份；转接团员组织关系；方便团员参加团内活动；记载团员获得的团内奖励；进行团员年度团籍注册；作为团员参加团内民主选举和表决的资格。
入团申请书：《入团申请书》用于表达自己入团的意愿，只有经过团组织批准，才能够加入中国共产主义青年团。
团档案的保存：团员青年可将个人的团籍档案与人事档案一并保管或将团籍档案交由本人单位团组织统一保管。
《中国共产主义青年团团员证管理暂行条例》中第十六条规定：团员凭团员证转接组织关系时，其团员档案（入团志愿书）可根据不同情况随之转移或由原团组织保存。
（一）凡在建有人事档案的企事业单位、学校、机关、部队入团的团员，因调动工作、毕业、复员转业需转移组织关系时，其入团志愿书应与人事档案一并转移。
（二）凡在未建人事档案的农村（包括农村中学、乡镇企业）入团的团员，其入团志愿书一般存所在基层团委，保存期限为十五年。这类团员因升学、参军、招工、招干需转组织关系时，入团志愿书随之转移。
参考资料来源：百度百科——中国共产主义青年团团员证
参考资料来源：百度百科-共青团员