股权转让纠纷，公司能作为被告，但是也是分几种情况的。,（一）股权转让双方之间的纠纷,涉及到转让双方之间的股权转让合同纠纷，如请求履行转让合同，请求支付股权转让款并赔偿损失或支付违约金，或者请求解除转让合同，请求认定转让合同无效等等。这类纠纷主要适用合同法的有关规定进行处理，应列合同的相对人为被告，涉及到公司利益的，应列公司为第三人。,（二）涉及其他股东优先购买权的诉讼纠纷,这类纠纷需要结合《公司法》与《民法典》相关规定进行处理，应列出让股权的股东为被告，公司为第三人，涉及其他的股东利益，一并追加为第三人。,（三）股权善意取得引发的纠纷案件,此类纠纷多产生于其他股东对于股权转让存在异议，一般是其他股东作为原告，而善意取得第三人与公司为被告。,（四）股权转让纠纷中涉及公司决议的纠纷案件,股权转让纠纷中涉及公司决议无效或撤销，当事人起诉请求确认股东会或者股东大会、董事会决议无效或者请求撤销上述决议的，应当列公司为被告，对决议涉及的相对利害关系人，可以列为共同被告或者第三人。,股权转让纠纷所适用的法律是《公司法》，最高人民法院《民事案件案由规定》在“第九部分与公司、证券、票据有关的民事纠纷”之“二十二、与公司有关的纠纷”项下列了一个第三级案由“248.股权转让纠纷”。,具体来说，股权转让纠纷是指股东之间、股东与非股东之间进行股权转让而发生的纠纷，包括有限责任公司的股权转让纠纷和股份有限公司的股权转让纠纷(即股份转让纠纷)两种情况。有限责任公司兼具人合性和资合性，《公司法》对其股权转让作出了相关的强制性规定;股份有限公司是典型的资合性公司，其股权以自由转让为基本特征。实践中，股权转让纠纷日益增多，尤其是有限责任公司的股权对外转让，因为《公司法》对其作出了较多的限制性规定，如转让时需经其他股东过半数同意、其他股东的优先购买权等，造成实践中关于股权转让合同的效力、优先购买权等引发的纠纷不断增多;此外，《公司法》还规定了公司在特定情形下应收购股东的股权，这类纠纷也有不断增多的趋势，因此，《民事案件案由规定》将股权转让纠纷列为第三级案由。,股权转让纠纷的起诉状必须符合一般民事起诉状的基本要求：首先，要有明确的被告，这里的明确是要能确定，如果是公司需要有公司全称，工商登记信息，已经注销的企业不能列为被告，假如被告是自然人，则需要有其身份信息，实践中主要是身份证复印件、户口本复印件或者公安机关打印的身份信息。其次，是诉讼请求必须明确，对于股权转让纠纷，其实质是股权的买卖合同纠纷，诉讼请求一般是要求继续履行合同义务，配合办理股权过户手续，或者在对方不履行合同义务的情况下主张追究违约责任。最后，股权转让纠纷的起诉状可以根据需要将涉案股权的公司列为第三人，因为转让的过程中会留有公司配合或参与的痕迹，对法院查明事实有帮助。
《中华人民共和国公司法》
第七十一条
有限责任公司的股东之间可以相互转让其全部或者部分股权。股东向股东以外的人转让股权，应当经其他股东过半数同意。股东应就其股权转让事项书面通知其他股东征求同意，其他股东自接到书面通知之日起满三十日未答复的，视为同意转让。其他股东半数以上不同意转让的，不同意的股东应当购买该转让的股权；
不购买的，视为同意转让。经股东同意转让的股权，在同等条件下，其他股东有优先购买权。两个以上股东主张行使优先购买权的，协商确定各自的购买比例；
协商不成的，按照转让时各自的出资比例行使优先购买权。公司章程对股权转让另有规定的，从其规定。