根系在土壤中的分布情况受砧木种类、品种、树龄、土壤条件、地下水位、地势、栽培管理技术的影响很大。
果树根系在土壤中的分布，有时还表现有明显的层性，各层的生长习性因树种、品种、砧木、土壤条件等不同而各异。最上层分根性强，角度大，分布范围较广，因为距地表较近，易受环境条件变化的影响；下层根分根性弱，角度小，分布范围也较小，因为距地表较远，受地上部环境条件变化的影响较小，在周年中的生长活动延续时间较长，甚至可以不停止生长。根系层性表现愈明显，便越较广深地分布于上下土层中，有利于广泛地摄取土壤中的水分和养分，而增进地上部的水分和养分供应能力，增强抗旱、抗寒、抗热、抗风的能力。