1. 用途差异：清关文件主要用于资金的省税、取款、转账至公司账户；而报关文件则用于依据法律法规办理各项结算，包括提取货物、支付员工工资福利等。一般存款账户则限于一般结算业务，不得提取现金，支付员工工资福利。
2. 性质区别：清关文件可以用于转账结算和现金存款，但不得用于现金提取。报关文件则可以随时存入或提取资金，但提取的资金必须通过公司转账支票转入公司基本账户，再通过公司现金支票进行支付。
3. 应用范围：清关文件主要适用于国际贸易领域的货物，如跟单商业信用证与国际贸易领域紧密相关。报关文件的应用范围更广，不仅限于国际货物贸易，也适用于国内货物贸易，常用于确保合同项目投标人履行义务、融资过程中债务人还款期限的履行、技术交易结算、租赁及其他形式的支付或性能保证。
清关文件准备：
1. 必备单证包括货物装箱单、发票、合同一式一份、报关、报检委托书各一份。
2. 进口货物如来自欧盟、美国、韩国、日本，若为木制包装箱，需提供热处理证书或植物检疫证书；非木制包装则需提供无木制包装证明。
3. 依照税则规定需提供各项证件，如进口许可证、机电证、重要工业品证书等。
4. 有减免税手册的，需提供减免税证明手册。
报关基本程序：
1. 接受申报
2. 审核单证
3. 查验货物
4. 办理征税手续
5. 结关放行
清关基本程序：
1. 换单
2. 电子数据申报
3. 报检
4. 现场交接单
5. 查验
6. 放行
扩展资料：
报关流程是指进出口货物收、发货人、运输负责人、物品所有人或其代理人按照海关规定，办理货物、物品、运输工具进、出境及相关海关事务的手续和步骤。
清关，即结关，是指进出口或转运货物出入一国关境时，依照各项法律法规和规定应当履行的手续。只有在完成各项义务，如海关申报、查验、征税、放行等手续后，货物才能放行，货主或申报人才能提货。同样，载运进出口货物的各种运输工具进出境或转运，也均需向海关申报，办理海关手续，得到海关的许可。货物在结关期间，不论是进口、出口或转运，都是处在海关监管之下，不准自由流通。
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