无论普通储蓄存款，还是大额存单，农商行的利率都高于农业银行。
综合实力比较
农行农行作为传统大型国有银行之一，网点遍布全国各地。农行具备全面的金融牌照，能提供的业务种类繁多，可以为客户办理各种类型的金融业务。
并且农行属于老牌四大行之一，其品牌知名度高，备受百姓认可。所以农业银行不需要过高利率水平，就能顺利吸收大量储户存款。
农商行农商行多在本地农信社基础上改制组建而来，截止2018年末，全国农商行数量达到近1400家。
但是农商行虽然多，但都是具有独立法人的地方农村商业银行，各自为战，不像农行似的，是全国“大一统”的商业银行。
农商行的发展立足本地，以服务三农及本地中小微机构为主。而根据监管规定，农商行无法跨地域开设网点，只能立足于本省内发展业务，所以发展受限。
为了提高自己的揽储能力，提升地域内竞争力，农商行必然需要提高存款利率。因此农商行的利率水平一般都属于本地域内较高的存在。
存款利率比较
农业银行存款利率并不高，官网挂牌利率比较低，仅比基准利率高一点，官网存款利率一年期仅有1.75%，三年期的也才2.75%。
当然，各地农业银行会根据本地域内利率水平调整自己的实际执行利率。
而农行大额存单利率，以20万元起存，并且存款金额越大，利率水平越高。
农商行存款利率多能在地域内位居第一阵营。
农商行的普通储蓄存款利率最高可以在基准利率基础上浮50%。而地方农商行发行的大额存单利率，20万起存，利率可以在基准利率基础上浮55%，利率最高执行情况如下图所示：
存款安全性
农商行和农业银行都属于银行系统，受监管部门监管约束，同样受存款保险保护。
我们储户在银行50万以内的存款本息，都是100%安全的。
农行作为传统大行，安全性上高于农商行，有个词叫做大而不倒，只要国家金融稳定，其倒闭风险也基本为零。农商行虽然不及农业银行，但是存款保险覆盖95%以上的储户存款，且仅存在理论上的风险。
总结
综上所述，农商行各地都是独立的法人机构，各成体系，为了吸储揽存，提高竞争力和地区占有率，利率水平必然比农行要高。