东莞三局医院门诊部设施完善，包括急诊科、内科、外科、妇产科、儿科、骨伤科、眼科、耳鼻喉科、口腔科、皮肤科、性病科、中医科以及体检、妇保、儿保等门诊。其中，心血管病、肝炎、泌尿、骨质增生病专科门诊专为特定疾病提供服务。医技部门设有化验室、放射科、B超室等，如心电图室、电子胃镜室、电子肠镜室等，以满足各类检查需求。
住院部涵盖内科、儿科、外科、骨科、妇产科、手外科、五官科、中医综合科和麻醉科。内科有应急抢救能力，如有机磷农药中毒、食物中毒和心肌梗死等危重病症；外科能进行各类手术，如胃切除、肝破裂修补等；五官科则进行白内障摘除和乳突根治术；妇产科在产后大出血和剖宫产等手术上具有丰富经验；泌尿专科采用体外碎石技术治疗结石；中西医结合治疗骨折、皮肤病和性病；中医治疗湿热病、男女性病等疑难杂症。
医院始终坚持“以病人为中心，以质量为核心”的服务理念，秉持“患者第一、服务第一、质量第一、信誉第一”的办院宗旨，追求“院有重点、科有特色、人有专长”的发展策略，以及“人道博爱、敬业奉献、求真务实、创新争先”的管理理念。医院致力于深化改革，优化管理，内外兼修，强化职业道德建设，提升社会信誉和医务人员的专业声誉，致力于打造更高效、更专业的医疗服务环境。
东莞三局医院1970年创建，位于东莞市塘厦镇花园街，现已发展成为集急救、门诊医疗、住院医疗、预防、保健、康复于一体的二级综合性医院，被卫生部授予爱婴医院，东莞市社保医疗和工伤定点医院。