从分子结构与燃烧的本质上看，上述现象的本质是由于引起燃烧的本质原因不同。
闪点低，燃点低，是易挥发的液体或气体，特别是小分子的气体与
挥发性液体，它们被点燃时，一定是有一个火种，而这个火种的火焰能量足以能够令这种低闪点或低燃点物质产生能够燃烧甚至持续燃烧的能量，这个燃烧过程是燃烧物质间的传递燃烧能量的过程，是燃烧的
等离子态物质扩散过程。
而自燃过程则不同，是可燃物质在温度升高过程中，形成能够达到与助燃物反应的
自由基的过程，而自由基形成过程，对于小分子的物质是较为困难的，因为相对大分子物质而言形成自由基是容易的，而自由基是燃烧过程中形成等离子态的中间过程。在没有火种的情况下，也就是没有自由基的前提下，达到燃烧状态，是需要较高温度的甚至是非常高的温度的。氢气与空气在没有静电火花及催化剂的前提下，如果要发生自燃，温度会超过500度。原因是氢气的离解成类似自由基的稳定的
氢原子是很困难的。而一些大分子的物质，由于分子受热不稳定，易于形成稳定的自由基，进而与氧反应产生燃烧。