南京科进实业有限公司自1996年诞生以来，扎根于东南大学，由蒋建清教授担任董事长，开启了其稳健的发展历程。同年，公司成功研发了国内首台基于Windows32平台的TCD，引领了国内TCD技术的新时代，并具备脑电地形图功能。
1998年，江苏省医药管理局和南京市领导的参观与肯定，激励了科进科研团队，公司获得了KJ-1型脑电-脑血流诊断系统试产注册，正式推向市场，产、学、研结合的模式得到了官方的认可。
1999年，科进公司研制出56阵线阵便携式B超，并与美国AD公司合作研发高灵敏度超声换能芯片，应用在TCD产品上。2000年，科进开发出国内首台Windows2000平台的KJ-2型彩色经颅多普勒仪，并获得准产注册，通过了ISO9001+YYT0287质量体系验收，取得了医疗器械生产许可证。
2001年，KJ-2000X型便携式B超在科进公司投入生产，公司研制的轻巧便携的TCD产品，主机重量仅5公斤，双探头和内置喇叭，显示了其技术实力。2002年，公司产品质量经国家食品药品监督管理局抽检，KJ-2000X型B超被评为合格产品，8MHz CW探头也成功应用于经颅多普勒系统。
2003年至2006年，科进公司产品不断突破，多通道、多深度经颅多普勒仪在博览会上展出，TCD技术及产品在国内外市场取得显著进展，产品质量屡获认可。2008年，公司开发出四通道、八深度、八探头的数字化TCD，进入国际市场，还获得了韩国超声骨密度仪在中国的代理权。
2009年，科进公司的产品质量和服务连续两年被江苏省食品药品监督管理局授予诚信单位称号，TCD产品通过了国内外的严格检测，进入欧洲市场。同年，公司还开发出国内首台电池驱动的笔记本式TCD，与军医大和南京易爱展开国家863计划项目合作。
南京科进实业有限公司是专业医疗器械生产企业，源于东南大学，具有14年超声经颅多普勒研发和生产经验，是国内这一技术领域的领跑者。 迄今为止，已有三千多家国内医疗机构和数百家海外医院正在使用我们的产品，我们竭诚为用户提供服务，使产品为用户创造价值。