仙客来的病虫害有灰霉病、细菌性软腐病、病毒病、炭疽病、蚜虫、菜青虫、螨、线虫、蛞蝓等。
1.灰霉病，是仙客来的头号病害，造成叶枯，柄断，花腐。初发病时叶、花炳出现暗绿色至黄白色水浸状小斑点，在高温高湿下迅速蔓延，呈褐色发软的不规则大病斑，表面皱褶或略具轮纹，上生黄褐色或灰黄色霉层，并生黑色小粒状菌核。使叶片、叶柄，花梗腐烂，特别是花梗短靠近土面的，更易感病。病菌在土壤病残体过冬，气流传播，伤口侵入，在气温20℃、湿度大时，盆花摆放过密时最易发病。盆土、种子消毒是防治的根本，发病初期，可用70%甲基托布津可湿性粉剂800倍或50%多菌灵600倍液，每隔10～15天一次，连喷2～3次，才能控制。
2.病毒病，从苗期到开花期均可发病，有斑驳、丛生、条纹、斑点、疣状物等表现。病原是黄瓜花叶病毒、烟草花叶病毒。汁液传毒，棉蚜、黄褐螨亦是传毒介体。将种子放在75%酒精处理1分钟，或1%升汞水处理1.5分钟，或10%磷酸三钠处理15分钟，洗净后放在35℃温水中自然冷却24小时后播种，可降低发病率。亦可以进行热处理，先将种子放在40%聚乙二醇溶液内，在38.5℃恒温箱中48小时，脱毒率可达77.7%，亦可用茎尖培养脱毒。
3.根结线虫，在主侧根上形成圆形瘤状物，切开可见乳白色发亮的点粒，即为线虫。由南方根结线虫，北方根结线虫，花生根结线虫以及高弓根结线虫等引起发病，30～50天发生一代，一年3～5代。可用日光曝晒法和高温干燥法进行土壤消毒，晒30天左右。
4.炭疽病初见淡褐色小斑，扩大成圆形，有轮纹，上长黑色小点粒。可用70%炭疽福美500倍液防治。
5.细菌性软腐病，初见水渍状小斑，扩大后褐色软腐。可用0.5%波尔多液保护和200毫克/升链霉素防治。
6.茶黄螨，一年发生20多代，虫体小，淡黄色至深琥珀色，不耐高温，耐高湿，7～8月份发生重。可用15%氯螨净2000倍或华光霉素800倍防治。
7.蛞蝓，一年发生2代，5～6月危害最烈，除捕杀外，可在花盆周围撒石灰粉。
8.蚜虫，可用50%辟蚜雾2000倍或50%灭蚜松乳油1000倍防治。