国务院直属机构、国务院组成机构主要有领导体制，部门 规格，组成人员的区别 ：
1、领导体制的不同，国务院组成部门是在国务院统一领导下，负责领导和管理某一方面的行政事务，行使特定的国家行政权力。国务院直属机构是在国务院统一领导下，主管某项专门行政业务的机构。
2、部门 规格的不同，国务院组成部门的规格，高于直属机构。组成部门的负责人都是国务院组成人员，参加国务院全体会议，直属机构负责人只能在涉及本部门事项的会议时才能列席。
3、组成人员的不同，国务院组成部门行政首长均为国务院组成人员（由全国人大常委会任免）。国务院直属机构行政首长经国务院常务会议讨论决定，由总理任免，他们不是国务院的组成人员。
扩展资料：
国务院的组成部门
1、中华人民共和国外交部
2、中华人民共和国国家发展和改革委员会
3、中华人民共和国科学技术部
4、中华人民共和国国家民族事务委员会
5、中华人民共和国国家安全部
6、中华人民共和国司法部
7、中华人民共和国人力资源和社会保障部
8、中华人民共和国生态环境部
9、中华人民共和国交通运输部
10、中华人民共和国农业农村部
11、中华人民共和国文化和旅游部
12、中华人民共和国退役军人事务部
13、中国人民银行
14、中华人民共和国国防部
15、中华人民共和国教育部
16、中华人民共和国工业和信息化部
17、中华人民共和国公安部
18、中华人民共和国民政部
19、中华人民共和国财政部
20、中华人民共和国自然资源部
21、中华人民共和国住房和城乡建设部
22、中华人民共和国水利部
23、中华人民共和国商务部
24、中华人民共和国国家卫生健康委员会
25、中华人民共和国应急管理部
26、中华人民共和国审计署
教育部对外保留国家语言文字工作委员会牌子。科学技术部对外保留国家外国专家局牌子。工业和信息化部对外保留国家航天局、国家原子能机构牌子。自然资源部对外保留国家海洋局牌子。生态环境部对外保留国家核安全局牌子。
国务院直属机构
1、中华人民共和国海关总署
2、国家市场监督管理总局
3、国家体育总局
4、国家国际发展合作署
5、国务院参事室
6、国家税务总局
7、国家广播电视总局
8、国家统计局
9、国家医疗保障局
10、国家机关事务管理局
国家市场监督管理总局对外保留国家认证认可监督管理委员会、国家标准化管理委员会牌子。国家新闻出版署（国家版权局）在中央宣传部加挂牌子，由中央宣传部承担相关职责。国家宗教事务局在中央统战部加挂牌子，由中央统战部承担相关职责。
参考资料来源：百度百科--国务院直属机构
国务院组成部门依法分别履行国务院基本的行政管理职能。国务院组成部门包括各部、各委员会、中国人民银行和审计署。国务院直属机构主管国务院的某项专门业务，具有独立的行政管理职能。本回答被提问者采纳