2006年7月9日至14日，大理崇圣寺开光大典系列文化活动在大理崇圣寺举行，活动的主要内容为7月9日迎请阿嵯耶观音回家。7月11日贯彻首届世界佛教论坛共识座谈会。7月12日大理崇圣寺开光大典系列活动剪彩仪式；高僧大德合影留念；大理崇圣寺开光大典；崇圣寺佛教研究院揭牌仪式；高僧大德同植菩提树活动；佛教文物展剪彩仪式；佛光普照焰火晚会。7月13日云南省佛教协会副会长释崇化荣膺方丈升座庆典；文物装藏仪式；书画家笔会。7月14日祈祷世界和平、祖国统一、民族团结、风调雨顺——观音祈福法会；各国高僧签名祈愿并敬装入千寻塔活动 。
2008年5月12日四川省汶川地震后，大理崇圣寺僧团及护法居士为四川汶川地震灾区同胞做为期7天的诵经祈福超荐法会 。
2010年9月24日至10月19日，“传授三坛大戒”法会于崇圣寺举行。此次法会是崇圣寺第二次传戒法会，共有来自中国各地的156位新戒云集崇圣寺。由三师、七尊证及诸位引礼师传授佛法、戒律，使新戒弟子进一步纯正信仰、严守戒律，成为合格的比丘。此次传戒法会如法如律，严格按照《三坛大戒传授正范仪轨》进行，法会圆满顺利 。
2010年3月4日，大理州佛教协会主办，大理崇圣寺承办的抗旱赈灾祈福法会在大理崇圣寺举行。来自大理白族自治州各县市各大寺院的高僧大德、法师、居士近300人诵经祈福。为体现佛教慈悲济世精神，法会进行了募捐仪式，共收到126504.1元善款，作为专款投入抗旱救灾工作 。
2012年7月5日，“传授二部僧三坛大戒”法会于大理佛都崇圣寺、大理万佛寺举行。来自中国各地的逾360名新戒弟子齐聚，参加为期一个月的受戒仪式，为能成为一名合格的比丘（比丘尼）接受必需的戒体 。
2012年11月19日，崇圣寺举行首次传授居士菩萨戒法会。来自全省各地的650多名新戒弟子齐聚大理崇圣寺，参加为期一个星期的受戒仪式。法会最后，在三师七证的印证下，众居士菩萨登千花台，圆满菩萨戒，领受戒体 。
2013年4月20日四川省雅安地震后，大理崇圣寺僧团及护法居士于4月24日为四川雅安地震灾区同胞做为期7天的诵经祈福超荐法会，祈愿雅安罹难者往生净土 。
2013年10月11日至18日，崇圣寺举行了第一届的“众姓万缘水陆法会”。此届法会共设七个坛口，大坛设在大雄宝殿。整个寺院各殿堂分别设有：“诸经坛”、 “法华坛”、 “净土坛” 、“华严坛”、 “楞严坛”，内坛和外坛的法事布置鲜花供养。各大德、法师如法如律地举行诵经、礼忏、持名、请圣、斋天、放生、施放瑜伽焰口、普佛、说幽冥戒、送圣等法事活动 。
