一、分辨牡丹鹦鹉公母的方法之一是通过触摸其裆部，感受耻骨的位置和形状。通常，六个月大以上的鹦鹉更容易区分：
- 公鹦鹉的耻骨紧靠在一起，不分开，且骨头尖细。
- 母鹦鹉的耻骨则向两侧略微分开，中间有空隙，且骨头相对圆滑、粗大。
这种方法虽然有一定难度，但是最准确的。六个月以下的小鹦鹉可能难以准确判断，但六个月以上只要细心触摸，一般可以分辨出来。无论外表如何，鹦鹉的骨骼特征总是与性别相符。
二、观察牡丹鹦鹉的交配行为也是区分公母的一种方式：
- 正常情况下，公鹦鹉会站立，头部向下，母鹦鹉蹲下，头部向上接受食物，并伴有碎叫声。交配时，公鹦鹉会从侧面或后面上体，母鹦鹉身体下伏，翅膀张开，尾巴抬起。
- 如果两鹦鹉平行站立喂食，没有食物传递，可能是同性。
- 如果两鹦鹉互相喂食，也可能是同性。
- 如果两鹦鹉互相踩背，并迅速交换位置，也可能是同性。
三、在繁殖期间观察公母鹦鹉的行为可以进一步确认性别：
- 如果一只鹦鹉下蛋后，观察两只鹦鹉的行为。通常，母鹦鹉会孵化蛋，而公鹦鹉不会参与孵化。如果两鹦鹉都留在巢箱中不出来，可能是两只母鹦鹉。
- 如果蛋的数量正常，母鹦鹉会孵化蛋。公鹦鹉只会负责守卫和喂食。
- 如果巢箱中有两只鹦鹉，且它们已经足够成熟（一年以上），但没有下蛋，那么可能是两只公鹦鹉。需要注意的是，这种情况相对较少，因为母鹦鹉在牡丹鹦鹉中较为常见。
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