1.阿笠博士柯南亲口承认（TV 2） 2.工藤夫妇（工藤优作、工藤有希子） 由阿笠博士转告（TV 43） 3.服部平次在事件中察觉，逼柯南亲自承认 （TV 58） 4,宫野明美（已死）柯南亲口承认 （TV 128） 5.灰原哀（宫野志保）调查发现 （TV 129） 6.贝尔摩德见过新一小时候照片 7.怪盗基德（黑羽快斗）76集中怀疑。在假扮白鸟监视柯南发现，并且为了还柯南救他鸽子的情，扮成新一帮他逃过小兰的怀疑。（M 3《世纪末的魔术师》） 8.本堂瑛佑推理得知，设计逼柯南亲口承认 （TV 508） 9.诺亚方舟（即泽田弘树已死）通过诺亚方舟DNA鉴定得知（M 6《贝克街的亡灵》） 10.Irish（爱尔兰，黑衣组织成员。已死） 通过指纹对比发现，没有报告组织（M 13《漆黑的追踪者》） 11.鲁邦三世、次元大介、石川五右卫门、峰不二子：原因不详（出自《鲁邦三世VS名侦探柯南》，由柯南制作委员会与鲁邦三世制作委员会合作推出，对柯南的主线剧情发展毫无影响，可以无视） 下面这几个存在争议，剧情中未表示他们确切知晓柯南身份，但对此产生过怀疑，如果进行调查是可以轻易查明的这一点： 1.茱蒂·斯泰琳、赤井秀一、詹姆斯等FBI 2.高木警官、佐藤警官 3.水无怜奈 4.冲矢昴 5.世良真纯
参考资料：百度工藤新一百科