在废水生物除磷过程中，
活性污泥在好氧、厌氧交替条件下时，在活性污泥中可产生所谓的“聚磷菌”，聚磷菌在好氧条件下可超出其生理需要而从废水中过量摄取磷，形成多聚
磷酸盐作为贮藏物质。在生物除磷
污水处理厂中，都能观察到聚磷菌对磷的转化过程，即厌氧释放磷酸盐——好氧吸收磷，也就是说，厌氧释放磷是好氧吸收磷和最终除磷的前提条件。
污水生物除磷是利用聚磷菌的超量磷吸收现象。聚磷菌在厌氧条件下，会释放出在好氧条件下吸收的磷。进入好氧区后，聚磷菌可将积贮的PHB好氧分解，释放出的大量能量可供聚磷菌生长繁殖。微生物在好氧条件下吸收的磷大大超过在厌氧条件下释放的磷。由于系统经常排放剩余污泥，被细菌过量摄取的磷也将随之排出系统，因而可获得较好的除磷效果。
影响除磷的因素
溶解氧
首先必须在厌氧区控制严格的厌氧环境。这直接关系到聚磷菌的生长状况、释磷能力及利用有机基质合成PBH的能力。
其次是必须在好氧区提供充足的溶解氧。以满足聚磷菌对储存的PHB进行降解，释放足够的能量供其过量摄磷之用，以便有效的吸收废水中的磷。
硝酸盐含量
硝态氮的存在也会消耗有机基质而抑制聚磷菌对磷的释放，进而影响好氧条件下聚磷菌对磷的吸收。另外，硝态氮的存在会被部分聚磷菌作为电子受体进行反硝化，从而影响其以发酵产物作为电子受体进行发酵产酸、抑制聚磷菌的释磷和摄磷能力及PBH的合成能力。
温度
一般来说，在五到三十度范围内，都可以收到较好的除磷效果
PH值
PH值在中性左右时，磷的释放比较稳定
BOD负荷和有机物性质
一般认为，进水BOD5/TP大于15，才可以获得理想的除磷效果。为此，可以采用部分进水和跨越初沉池的方法，获得除磷所需的BOD量。
泥龄
一般以除磷为目的的生物处理系统的泥龄要控制在三到七小时
污水生物除磷工艺
除磷
工艺流程可分为主流程除磷工艺和侧流程除磷工艺两类。
主流除磷工艺的厌氧段在处理污水的水流方向上，其代表工艺有A/O、A2/O、Bardenpho 工艺、Phoredox 工艺、UCT、改良型UCT、SBR以及氧化沟工艺。
测流除磷工艺的厌氧段不在水流方向上，而是在回流污泥的测流上。比如 Phostrip 工艺。
生物除磷工艺优点：表现出除磷效果好，并能改进污泥沉降性能，减少活性污泥膨胀现象等。下面列举几个常用工艺，更多种类除磷剂资料请至
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