第五回中，妙玉的判词是“可怜金玉质，落陷污泥中”。而《世难容》曲中也有“好一似，无暇美玉遭泥陷；又何须，王孙公子叹无缘。”
在高鹗的续本第一一二回“活冤孽妙尼遭大劫，死雠仇赵妾赴冥曹”中，妙玉被内贼何三引入的贼人使迷香闷住掳走。得知妙玉被抓后，惜春心想“但是他素来孤洁的很，岂肯惜命？”而第一一三回中，宝玉也说“这个人必不肯受，一定不屈而死”。可见高鹗为她安排的结局是为强人所掳，不堪淫辱轻薄，自寻了断的。
当然，经过许多红学家的考证，高鹗的续本有极多违背曹雪芹原著的地方。这里我再提供给你一个结局，是刘心武先生《揭密古本<红楼梦>》中对妙玉结局的推测，不必全听全信，仅供赏鉴参考：
探佚第一百零五回《瓜州渡口妙玉现身，金山寺下悍王殒命》：贾府此时已然颓败，成为政治斗争的牺牲品。贾母殡天，贾政绞毙，黛玉沉湖，宝钗化蝶，凤姐投河，湘云被卖。而宝玉因当年写下的《妫婳将军词》而获罪，忠顺王通缉宝玉却因其容貌相仿而捉到了甄宝玉。贾宝玉听说此事，自首换出了甄宝玉。就在此时，妙玉违背师傅“不宜还乡”的遗命，来解救贾宝玉。
她带了几箱名瓷古玩——包括四十一回栊翠庵品茶中的几样茶具，在瓜州渡口遇见了被卖入“花船”做乐妓的史湘云，并将她赎出。而后去求见忠顺王，要求用家传的几箱名瓷古玩交换贾宝玉。然而贪婪的忠顺王见美色起淫心，要妙玉连人带物一起作交换条件。妙玉竟然应允。只是要求忠顺王当面放走宝玉，并要求宝玉和湘云一起远遁，不许派人追赶。
妙玉终于看到宝玉湘云遇合离去。忠顺王要抱妙玉上床求欢，妙玉却说要先赏玩珍宝，忠顺王答应了。当他贴近观看时，妙玉拉动了箱外的机关，箱中有消息儿炸药，妙玉和忠顺王同归于尽。
这一回还交代，妙玉少女时代跟陈也俊产生过恋情。“叹无缘”的“王孙公子”不是贾宝玉，而是陈也俊。妙玉舍身救赎宝玉的情况传到他耳中后，他悲痛中撰《叹无缘》曲表达敬意。
参考资料：《红楼梦》通行本，《刘心武揭密古本<红楼梦>》