基因克隆的方法有：
PCR扩增法。这是一种常见的基因克隆方法，其基本原理是利用特定的引物与模板DNA序列结合，通过DNA聚合酶的作用进行DNA复制。整个过程包括变性和退火两个主要步骤，其中变性是指使DNA解旋成为单链，退火则是引物与模板结合并进行复制。通过不断循环这两个步骤，可以得到大量的目的基因片段。这种方法操作简便，成本低廉，因此广泛应用于基因克隆和分子生物学研究中。此外还包括凝胶纯化法和反转录PCR法等更为精确的方法，可针对不同需求和场景选择合适的克隆技术。以上均为使用较为广泛的基因克隆技术。
除了PCR扩增法外，载体克隆技术也是常用的基因克隆方法之一。这种方法涉及到将目的基因片段插入到载体分子中，然后利用载体分子在宿主细胞中进行复制和传播的特性，达到克隆基因的目的。载体可以是质粒、噬菌体或病毒等，它们具有稳定的遗传特性和高效的复制能力。通过构建重组载体，将目的基因导入宿主细胞，经过培养和筛选，可以得到含有目的基因的克隆细胞株。这种方法广泛应用于基因功能研究、药物研发和基因治疗等领域。此外还有一些特殊的载体克隆技术如酵母人工染色体克隆技术等，用于特定的基因克隆需求。这些技术为基因克隆提供了重要的工具和方法。
另外，同源重组技术也是基因克隆的一种重要手段。该技术利用DNA分子间的同源序列进行重组，实现基因的体外操作和克隆。通过构建含有同源序列的重组质粒，将其导入宿主细胞，在细胞内通过重组过程将目的基因整合到染色体上。这种方法的优点是可以在分子水平上对基因进行精确操作，广泛应用于基因组学研究和基因治疗等领域。总之这些方法都是科研人员不断积累创新出来的专业科研成果在实践工作中科学家可根据研究需要选择合适的方法进行基因克隆。目前也有多种其他新型技术在研究中陆续使用未来技术或将革新会有更多新法诞生使克隆更加精准高效。