总体来说，苏州大学好，211工程的院校,江苏省省属重点综合性大学，其前身为创建于1900年的东吴大学。而南京医科大学就不仅具备这些硬性条件。
环境不错，四个校区，很宜人......
网页打开的速度也快一些，o(∩_∩)o...
http://www.suda.edu.cn/ http://www.njmu.edu.cn/（南京医科大学）
还要看你要学那个专业，医学方面的那就南京医科大学强了。
==补充======================================================
苏州大学的硕士点：应用心理学、发展与教育心理学、基础心理学
南京医科大学就应用心理学一个是，仅仅从这里就可以看出来了。
都在市区，不是在郊区，:-) 交通都方便