故事最后，枪声突响，罪恶的子弹飞入陈永仁的眉梢。他抽搐着，绝望地倒下。开开合合的电梯门，撞击着倒下而不甘的英雄，陈永仁终于结束了他的无间道之旅。
陈永仁死后，杨锦荣回到香港，把陈永仁已经遇害死讯告诉沈澄，他说无论如何也要来一趟，拜祭陈永仁。灵堂内冷冷清清，只有两个女人和一个小女孩，来拜祭他的朋友，就只有杨锦荣和沈澄。李心儿认识杨锦荣和沈澄，虽然他们没有表明身份，但暗中也保持联络。
杨锦荣和沈澄到了陈永仁殉职的大厦天台，插下三柱香。杨锦荣要做陈永仁还没有完成的事，要帮他恢复身份和解决卧底的事。经过半年的追查，李心儿终于从已故的警校校长叶Sir的遗物中，找到了陈永仁的警员档案，证实了他的警员身分。
陈永仁举殡的日子，在浩园内一片彷佛架在半空的草坪上，二十多个穿上整齐礼服的警员井然地排列，前方，巍立着陈永仁的墓碑。（剧终）
扩展资料：
剧情简介——
2004年，陈永仁（梁朝伟饰）被杀后两年，刘建明（刘德华饰）被警队内部调查，架空职权，被派无关重要的庶务工作。与妻子MARY的婚姻破裂，连与一岁女儿见面的机会也没有。身心俱疲的刘建明，每日的生活虽像走向地狱一样，但他相信坚持就会扭转局面。这时，年轻警司杨锦荣（黎明饰）凭着一页页丰功伟绩，以不到四十之龄，正迈向警队最高层；
刘建明看在眼里，好像看见以前的自己。一次机缘，刘建明与杨锦荣结为好友，却发现杨锦荣神秘的一面，他推测杨锦荣可能和自己一样，都是黑帮派入警队的卧底。决定重新做人的刘建明暗中追查杨锦荣身世之谜，千辛万苦找到一个又一个证据，可是每次最接近真相的时候，总是功亏一篑，还引来警队高层对刘建明的极度不满。渐渐，刘建明觉得杨锦荣根本毫无可疑，渐渐开始怀疑自己。