根据《关于租入固定资产进项税额抵扣等增值税政策的通知》（财税〔2017〕90号）的通知，高速公路通行费可
抵扣进项税额=高速公路通行费发票上注明的金额÷（1+3%）×3%
详细规定如下：根据《关于租入固定资产进项税额抵扣等增值税政策的通知》（财税〔2017〕90号）的通知，自2018年7月1日起，纳税人支付的道路通行费，按照收费公路通行费增值税电子普通发票上注明的增值税额抵扣进项税额，具体计算方式如下：
高速公路通行费可抵扣进项税额=高速公路通行费发票上注明的金额÷（1+3%）×3%
如果自2018年7月1日起，未取得增值税电子普通发票，仅仅取得纸质通行费发票，则不得抵扣进项税额。
附：《关于租入固定资产进项税额抵扣等增值税政策的通知》（财税〔2017〕90号）节选：
七、自2018年1月1日起，纳税人支付的道路、桥、闸通行费，按照以下规定抵扣进项税额：
（一）纳税人支付的道路通行费，按照收费公路通行费增值税电子普通发票上注明的增值税额抵扣进项税额。
2018年1月1日至6月30日，纳税人支付的高速公路通行费，如暂未能取得收费公路通行费增值税电子普通发票，可凭取得的通行费发票（不含财政票据，下同）上注明的收费金额按照下列公式计算可抵扣的进项税额：
高速公路通行费可抵扣进项税额=高速公路通行费发票上注明的金额÷（1+3%）×3%
2018年1月1日至12月31日，纳税人支付的一级、
二级公路通行费，如暂未能取得收费公路通行费增值税电子普通发票，可凭取得的通行费发票上注明的收费金额按照下列公式计算可抵扣进项税额：
一级、二级公路通行费可抵扣进项税额=一级、二级公路通行费发票上注明的金额÷（1+5%）×5%
（二）纳税人支付的桥、闸通行费，暂凭取得的通行费发票上注明的收费金额按照下列公式计算可抵扣的进项税额：
桥、闸通行费可抵扣进项税额=桥、闸通行费发票上注明的金额÷（1+5%）×5%
（三）本通知所称通行费，是指有关单位依法或者依规设立并收取的过路、过桥和过闸费用。