1、NTFS格式一般用于硬盘的分区，不适合于闪存盘。EXFAT格式是U盘闪存专用的分区格式。NTFS一般用于WINDOWS系统，EXFAT格式可以通用于WINDOWS系统和MAC系统。NTFS大支持256TB，exFAT大可达16EB。
2、NTFS适合于磁盘，exFAT适合于闪存盘。NTFS是日志式系统，不适合在U盘上使用，会大幅度缩短寿命。exFAT是微软特别为U盘推出的专用格式，解决了FAT32不能保存大于4GB的文件的限制。但兼容性不像FAT32好。
3、首先ntfs是日志式系统，不适合在U盘上使用，会大幅度缩短寿命。exfat是微软特别为U盘推出的专用格式，解决了FAT32不能保存大于4GB的文件的限制。但兼容性不像FAT32好。
4、相对于NTFS，exFAT可以支持更多设备和操作系统；它比FAT32支持的单个文件大，最大支持单文件1EB。(1EB=1073741824GB)非常适合用来存储大容量文件，还可以在Mac和Windows操作系统上通用。
5、NTFS对闪存寿命影响比较大，U盘格式化为exFAT之后存取速度会大幅降低，并影响使用寿命。区别适用范围不同exFAT：适合于闪存盘（U盘）。NTFS：适合于磁盘（机械硬盘、固态硬盘）。