1、首先你要明白，核心危机只是最终幻想7的故事前传，圣童降临只是最终幻想7的故事后传，至于故事的主轴部分，你漏掉了，就是1997年最早的最终幻想7正篇。
最终幻想7正篇紧接核心危机结束后的剧情，克劳德背负扎克斯的遗言，发誓成为一个强者，但由于身上浸泡四年的病毒细胞的作用与扎克斯离去的打击，他虽然仍知道自己叫克劳德，却渐渐浅意识里把扎克斯的意志当作为自己的使命，把自己当作扎克斯来活。
而后，克劳德遵循当年扎克斯的遗愿，成为了一名雇佣兵，由于过去的悲惨经历，他变成了一个冷漠多疑的人，直到遇到了爱丽丝，彼此心中都起了变化。
因为杰诺瓦因子的关系，克劳德在行为举止上像极了扎克斯，所以爱丽丝便加入他的队伍，成为他的战友，除了被他类似扎克斯的气质所吸引之外，也想借这机会调查扎克斯的死因。
至于二人究竟有没有暧昧情愫，这个是网友们争论了多年的话题，各有论点，不过确实没有确切答案了，因为爱丽丝在最终幻想7游戏的中盘就被萨菲罗斯一刀解决。
不过在圣童降临结局处，克劳德在幻觉中看见她跟扎克斯一起出现，这一幕还是可以说明SE公司的观点的。。他们终究还是一对。
2、Loveless只是一个古代的叙事诗，不断地读这本书，只是为了渲染杰内西斯的文学气息而已。。而书上不断提到的“女神”，是杰内西斯自己的美好信仰，其实是不存在的。在他身体劣化后，他不断寻找“女神”要来解除身上的痛苦，但一直无法解脱。至于书上提到的，只有一人成为了英雄，其实是一种暗喻萨菲、安吉尔和他的遭遇，杰内西斯是一个好胜心很强的人。
安吉尔在游戏中盘就被扎克斯解决了，后来那只复制体，可以理解为是他正义的精神所在。
杰内西斯的去向，请看这里：
http://zhidao.baidu.com/question/76813730.html3、前面已经讲过了，圣童降临里出现的，只是2人的幻象，表示他们在克劳德心中深刻的地位。