是统一在民生路上的上海市出入境管理局办理（上海市浦东新区民生路1500号）的，派出所是不接受办理的。
周六（9：00-17：00）可以办的。要注意的是：1、必须本人亲自前往（儿童可以由家长代办）；2、必须带好身份证和户口本原件；3、照片必须是护照照片（也叫小二寸），背景必须是白色的。可以在任何照相馆拍好，12元4张，也可以当场在出入境办证中心拍，但浪费时间。所以，建议事先拍好。；4、事先复印好身份证（注意正反面都要），户口本的每一页（注意包括第一页），在那里复印，需要2元一张，贵！可在网上下载好表格材料（上海市公安局-网上办事）。若是个人再次签注或者本市单位港澳商务签注可以提前网上预约的。
见下：
上海居民如何办理《往来港澳通行证》
1. 受理点—上海市出入境管理局
地址—浦东民生路1500号(近迎春路) 联系电话—28951900
2. 办理时间
周一至周六：上午9：00—下午17：00
3. 办理时限
申请资料齐全后，10个工作日内办结；再次申请7个工作日内办结。
4. 申办手续
i) 提交填写完整并贴有申请人近期正面免冠彩色照片(48*33mm、背景为白色)的《上海市居民往来港澳地区申请表》和相同规格照片2张。
ii) 申请人交验有效《居民身份证》、户口簿或者其他户籍证明原件并提交复印件(再次申请可免交)；
iii) 下列(特定身份)人员还需提交单位意见：
(1) 在职和退(离)休的市管干部；
(2) 各级机关包括工、青、妇等人民团体和各民主党派机关中处级领导干部；
(3) 涉及国家政治、经济、完全、商业秘密以及金融、财税、科研、教学等机关、国有企事业单位的重点岗位工作人员；
(4) 参照以上规定的在沪中央直属单位，外省市自治区驻沪单位的工作人员。
特定身份人员在通行证有效期内再次申请，可免交单位意见。
5. 入境有效期
一次入境有效访问签注，有效期为3个月，停留期为7天；
二次入境有效访问签注，有效期为3个月，每次停留期为7天；
6. 申请人
首次申请，申请人须亲自办理。再次申请，可委托亲属代办申请。16周岁以下和60周岁以上申请人可由亲属代办。
7. 收费标准及依据
往来港澳通行证100元/证；一次有效签注20元/件；二次有效签注40元/件；手续费5元/人次。
如果参加旅游团，往来港澳旅游签注手续由旅行社代办。旅游签注分往返签注和单程签注两种，往返签注（即由香港去澳门再返回香港），单程签注（从香港去澳门，由澳门经珠海拱北海关回内地）。
参考资料：上海市公安局