储存直接用容器密封就可以，防毒应当配备防毒面具、防护面罩、胶手套等。
保存与运输硫酸二甲酯属于剧毒化学品运输范畴，故必须由具备危险化物运输资质的危货运输企业负责，要办理剧毒化学运输通行证，要按规定的线路和时间运输，要办理剧毒化学品购买凭证或准购证，司机要有危货运输资格证，要有押运员，押运员要有资格证。运输车辆必须是危货运输车辆，要有符合标准的警示牌，要配备灭火器材，防毒面具、消毒用的苏打水、漂白粉、碱性肥皂、胶雨衣、胶手套、胶靴。在运输过程中如发生泄漏，要及时进行处臵，要及时向当地警方报警，驾驶员不要踩到泄漏区域，以防鞋将硫酸二甲酯带入驾驶室内，沾染硫酸二甲酯的衣物、胶手套、胶靴等，要经过消毒，放到驾驶室外。
对使用硫酸二甲酯的高毒岗位和高度危险部位应当配备防毒面具、防护面罩、胶手套等特种防护用品，另外，生产和中试现场还应配备适宜的应急抢险器具等，如雾化吸入器、灭火器材、消火栓等。