没有区别，指的相同的药物，因为最早是从黄连中提取的，所以以前叫黄连素，不过现在药用的都是化学合成的。
黄连素，别名小檗碱、盐酸小檗碱。黄连素在临床中一直作为非处方药用于治疗腹泻，但是现代药理学研究证实黄连素具有显著的抗心力衰竭、抗心律失常、降低胆固醇、抗制血管平滑肌增殖、改善胰岛素抵抗、抗血小板、抗炎等作用，因而在心血管系统和神经系统疾病方面将可能有广泛、重要的应用前景，日益受到重视。
用中医学解释，此类药物性凉，能清除邪热或虚热，清除有害毒物，自古以来就是中医手中的一味清热解毒良药。
扩展资料：
黄连素的副作用：
黄连素学名小檗碱，是从黄连、黄柏、三颗针等黄连属植物根茎中提取的生物碱，可用于部分类型的感染型腹泻，只适用于细菌感染引起的感染性腹泻，而对非感染性的腹痛腹泻，黄连素是毫无作用的。
黄连素具有高浓度杀菌，低浓度抑菌的特点。如果经常使用黄连素，不仅会使其抗菌效果降低，还可能出现类似抗菌药物的细菌耐药作用。
黄连素还会影响肠道消化酶的活性，对肠道益生菌的活性有抑制作用，破坏人体对维生素及脂肪酸的吸收。
过去，曾有长期大量服用黄连素导致B族维生素吸收障碍而引起周围神经炎的个案。因此，将黄连素作为腹泻腹痛的“万灵药”，不分青红皂白，不明确病因随意使用，不但不能取得疗效，反而会适得其反，并有可能延误最佳治疗时间。
参考资料来源：百度百科-黄连素
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