学位论文结构不合理通常指：“学位论文结构不合理通常指的是层次不清晰、逻辑不严密。
（一）作者科研能力不足
对学术型硕士研究生而言，科研能力是衡量硕士研究生教育成效的重要指标，而作为教育成果集中体现的学位论文，其所反映出的科研能力的强弱，可以作为判断硕士研究生教育质量的重要因素。
1、作者科研能力不足主要包括：
①文不对题
即论述不能很好地切合论题，甚至跑题、偏题。
②概念界定不清晰
即对论文中的核心概念或关键词的界定不清晰，导致论述不清或研究内容不明确。
③论述不严谨、不充分，推理不严密
即论文论证缺乏严密性，论述单薄，没有根据论题进行充分论述与阐释；存在逻辑上的缺陷或逻辑混乱，造成论文内容前后矛盾或有漏洞，致使读者无法准确把握作者的研究思路和研究过程，研究结论的可靠性也将受到质疑。
④理论性或研究深度不足
即论文在论述过程中，没有对论题的理论基础进行必要的分析介绍，理论基础薄弱；缺乏理论框架，使论述显得凌乱；论文的研究不够深入，没有对深层次的研究问题进行探究和解答，理论深度不够和缺乏学术性。
⑤研究重点不突出
即论文论述没有突出研究重点，缺乏问题意识，研究问题不明确，对论文观点缺乏提炼等。
2.研究方法的科学性不足
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