柯南剧场版排名是：《贝克街的亡灵》《通向天国的倒计时》《世纪末的魔术师》《迷宫的十字路口》《引爆摩天大楼》《瞳孔中的暗杀者》等。
1、《贝克街的亡灵》
02剧场版，讲述了少年侦探团及日本上流社会的孩子们参加一场科技体验活动，通过计算机的操作让大家沉睡于历史上曾发生不同事件的时代，并进行挑战的虚拟体验游戏的故事。剧场版公认的神作，模拟体验游戏，侦探间的致敬，以及白教堂血案VS贝克街的现实虚拟罪案对决，都是天作之合。
2、《通向天国的倒计时》
01剧场版，讲述了柯南与他的伙伴们破获双塔摩天大楼中的杀人案，并在危机中惊险还生的故事。剧场版巅峰之作！小兰跳楼、步美读秒、两秒飞车、灰原的自我牺牲、元太的不浪费一粒米饭以及博士的谜题，每个桥段的设计都足够清新自然，令人印象深刻。
3、《世纪末的魔术师》
99剧场版，讲述了围绕着罗曼诺夫王朝的秘宝“记忆彩蛋”意外地在日本发现，柯南与老对手怪盗基德，以及神秘第三方之间对彩蛋展开的争夺战。最震撼的一部柯南剧场版，情节和细节都很好，那个回忆之卵让人感动泪目，日本动漫中时常加入这种温情的因素，在紧张刺激中思考人性，最后那些照片出现音乐响起实在震撼人心。
4、《迷宫的十字路口》
03剧场版，讲述了柯南与服部联手调查发生在东京、大阪和京都三地的杀人事件，并最终揭开多年的历史谜题。
5、《引爆摩天大楼》
97剧场版，讲述了一个绝对对称完美主义的建筑师利用频频发生的爆炸案对柯南发起的极限挑战的故事。经典的开山之作，虽然画面和特效比不上后来的作品，但案子的紧张程度相当揪心，抖得包袱个个惊人。
6、《瞳孔中的暗杀者》
00剧场版，讲述了柯南破获与警察内部有关的婚宴枪击案，并在游乐园救小兰的故事。可以说是所有剧场版里情节最紧凑转折最多，感情戏也最丰富的一部，临近结尾追逐场景的演出目不暇接，后作即便制作再精良也望尘莫及。
