鸟的种类减少，种群结构发生变化
根据历年考察结果比较，洪湖鸟类种数在不断减少，种群结构也在发生较大变化。仅用1981～1982年考察结果与1996～1997年考察结果相比较，洪湖鸟类在15年间共减少2科34种，平均每年减少2种以上。过去数量较多的种类其物种多样性呈明显下降的趋势，种群结构也在发生很大改变。如在50年代至60年代初期，洪湖地区白鹳、黑鹳、中华秋沙鸭、赤麻鸭、额雁、豆雁、灰雁等鸟类较多，但到80年代末期已经罕见。而数量较多的鹭科、鸭科和秧鸡科的种类，如苍鹭、大白鹭、白鹭、绿翅鸭、绿头鸭、罗纹鸭、赤颈鸭、骨顶鸡等，到90年代初期其数量也在下降，并且鸟的种群结构也发生了大的变化。鸭科中以潜鸭类、赤膀鸭和斑头秋沙鸭为优势种，约占洪湖野鸭的95%，但其中又以潜鸭类(主要红头潜鸭)为主，约占60%，秧鸡科以骨顶鸡为主，其比例达到87.22%。
湖泊水禽资源比较丰富，但种群数量波动幅度大并呈下降趋势
洪湖水禽在20世纪70年代以前有112种及5个亚种、隶属11目、22种，湿地水禽占全市鸟类的67%。其中留鸟12种，夏候鸟25种，冬候鸟61种，旅鸟14种，但以冬候鸟占优势，为54.44%。在具有商品价值的经济水禽有33种，占总数的29.5%，占冬候鸟的50%以上。包括骨顶鸡在内的雁鸭类，最高产量达35× 104kg，为江南六省主要的野鸭产区。到90年代后期，洪湖水禽种类仅有63种，占全市鸟类的47.4%。种类以鸭科和鹭科等冬候鸟占优势，其比例达60.3%，分别为26种和12种;而种群数量以秧鸡科和鸭科占优势，高达总数的80%以上。
2003年1月30日～2月2日，世界自然基金会组织专家在洪湖水禽的主要分布区进行了为期三天的水鸟调查，只发现越冬水鸟14种。为保护洪湖日益恶化的生物资源和生态环境，2003年国家正式启动了洪湖保护与恢复示范工程项目，世界自然基金会也在洪湖市启动了洪湖生物多样性保护与重建江湖联系项目，经过一年多建设，洪湖保护与恢复示范区的生境和物种得到了改善。2004年2月15日～16日，世界自然基金会组织专家对洪湖保护与恢复示范区的水鸟进行了为期两天的调查，记录越冬水鸟27种，同时发现该区域内新增记录鸟类5种。示范区的生物恢复效果得到了专家的充分认定。
但要真正保护好洪湖水禽，距实际恢复的指数还很远，就最近十年的数据表明，洪湖水禽无论种类还是种群数量均在减少，并呈波动下降趋势。为了保护洪湖生态系统，恢复鸟类资源，1996年洪湖市在全省率先建立了湿地自然保护区。荆州市人民政府、洪湖市人民政府相继出台了关于加强野生动物保护的地方性法规，洪湖市、监利县林业局分别成立了野生动物保护站，专门就洪湖地区的野生动物特别是鸟类进行了较好的保护，湿地水禽资源开始有所恢复。
洪湖鸟类演替的主要原因
20世纪近40年来，洪湖鸟类种群结构和数量均发生了很大变化。究其原因，一是由于湖泊环境变化引起。从20世纪60年代以来，因为兴修水利和大面积围湖造田，洪湖面积从初始的760km2减少到现在的348.2km2，湖泊植被特别是挺水植物(主要是芦苇和蒿草)遭到大面积破坏;另外随着人口的不断增长，从80年代初期开始，湖区渔民为了生存或获取更大经济利益而大搞拦围网养鱼，水面不断被分割，大大缩小了湖面，使水草大为减少。这种湖泊环境的改变不但减少了湖泊鸟类的栖息地和隐蔽所，而且对依赖这种环境而生存的其他野生动植物也造成了破坏或损害。
生物结构的改变，导致整个湖泊生态系统发生变化，物种多样性指数下降;二是滥猎乱杀加剧了湖泊鸟类栖息环境的恶化和物种的迁移。当地人采用铳打、毒杀等不法手段滥猎乱杀湖泊水禽，对鸟类资源造成直接破坏。自从成立洪湖自然保护区后，尽管洪湖市政府对此采取了很多打击措施，但仍存在极少数不法分子毒杀水禽的现象;三是破坏性地开发利用湖泊资源影响了湖泊水禽的生存条件。比如大湖中对鱼类的无节制捕捞，会造成鱼类资源的减少，导致以鱼虾为食的水禽鸟类缺乏食物而另择栖息地;过度打草也直接影响植食性水禽鸟类的生存。 实际上湖泊生态系统中食物链网结构很复杂，生物因子和非生物因子(包括以上几个主导因子)与鸟类的栖息、越冬、繁衍密切相关。在对洪湖自然保护区鸟类的保护和建设工作中，首先要按生态学原理恢复和优化洪湖生态系统，杜绝人为捕杀，为湖泊水禽营造良好的生存和繁衍环境。