煤矿通风防治科应该负责组织和推进煤矿的防治水灾工作。为了做好防治水灾的工作，可以采取以下措施：
制定水害防治措施方案。针对不同类型的水害情况，制定相应的应急预案和安全生产措施，并组织人员进行培训和演练，提高应对突发事件的能力。
安装监测设备。通过安装流量、水位和水质等监测设备，对矿井内主要水源和隐患点进行实时监测，及时掌握井下水情，为采取防治措施提供技术依据。
做好矿井排水系统的维护。加强矿井排水系统的检查、清理和维修，确保其畅通有效，减少因管道漏水等原因导致的事故发生。
与周边环境协调联动。加强与上下游矿井或地面水系建立联络机制，开展联合巡视和应急演练，提高水害处理能力。
组织现场管理。加强现场管理，实行24小时监控和管理，做到一旦发现水灾隐患就立即采取相应的防护和处理措施，防止事故扩大和蔓延。
总之，做好矿井水灾防治工作，需要科学预防、整合资源、精细化管理，并严格执行安全生产法律法规，确保矿井生产平稳、持续、高效。